FLNA - FLNA

О вооруженной группе на севере Мали см. Фронт национального освобождения Азавада.

FLNA
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2AAV, 2БП3, 2BRQ, 2J3S, 2JF1, 2К3Т, 2К7П, 2MTP, 2W0P, 2WFN, 3CNK, 3HOC, 3HOP, 3ЧАС, 3ISW, 3RGH, 4М9П, 4P3W
Идентификаторы
Псевдонимы	FLNA, ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, филамин A, FGS2
Внешние идентификаторы	OMIM: 300017 MGI: 95556 ГомолоГен: 1119 Генные карты: FLNA
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq28 Начинать 154,348,524 бп[1] Конец 154,374,638 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A7,3 | X 37,89 см Начинать 74,223,461 бп[2] Конец 74,249,820 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание Rac GTPase • Связывание RAL GTPase • активность гомодимеризации белков • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • связывание фактора транскрипции • связывание опиоидных рецепторов мю-типа • активность преобразователя сигнала • связывание актиновой нити • небольшое связывание GTPase • связывание киназы • Связывание Rho GTPase • связывание актина • Привязка SMAD • Связывание комплекса Fc-гамма рецептор I • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком • Связывание GTPase • Связывание РНК • активность регулятора калиевых каналов • связывание ионного канала • связывание кадгерина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • очаговая адгезия • корковый цитоскелет • клеточная мембрана • Myb комплекс • дендритный вал • внеклеточная область • тело нейрональной клетки • клеточная кора • ядрышко • актиновая нить • актиновый цитоскелет • перинуклеарная область цитоплазмы • внеклеточная экзосома • цитоскелет • ядро клетки • апикальный дендрит • нитчатый актин • внеклеточный матрикс • межклеточное соединение • цитозоль • Z диск Биологический процесс • реорганизация актинового цитоскелета • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • отрицательная регуляция катаболического процесса белков • установление локализации белка • стабилизация белка • дегрануляция тромбоцитов • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция апоптотического процесса • кластеризация рецепторов • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • цитоплазматическая секвестрация белка • активация тромбоцитов • сборка митотического веретена • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • локализация белка на поверхности клетки • организация проекции клеток • Путь передачи сигналов дофаминового рецептора, ингибирующего аденилатциклазу • образование поперечных связей актина • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • положительная регуляция интегрин-опосредованного сигнального пути • Скопление тромбоцитов • узел соединения ячеек • регулирование миграции клеток • заживление ран, разрастание клеток • семафорин-плексиновый сигнальный путь • формирование радиальных глиальных каркасов • развитие коры головного мозга • морфогенез ресничек • локализация белка на плазматической мембране • положительная регуляция трансмембранного транспорта ионов калия • регуляция реполяризации мембраны во время потенциала действия клеток сердечной мышцы предсердия • регуляция реполяризации мембраны во время потенциала действия клеток сердечной мышцы • положительная регуляция пролиферации нервных клеток-предшественников • положительная регуляция миграции нейронов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2316	192176
Ансамбль	ENSG00000196924	ENSMUSG00000031328
UniProt	P21333	Q8BTM8
RefSeq (мРНК)	NM_001110556 NM_001456	NM_001290421 NM_010227
RefSeq (белок)	NP_001104026 NP_001447	NP_001277350 NP_034357
Расположение (UCSC)	Chr X: 154,35 - 154,37 Мб	Chr X: 74.22 - 74.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Филамин А, альфа (FLNA) это белок что у людей кодируется FLNA ген.^[5][6]

Функция

Актин-связывающий белок, или филамин, представляет собой белок массой 280 кДа, который перекрестно связывает актиновые филаменты в ортогональные сети в корковой цитоплазме и участвует в закреплении мембранных белков для актинового цитоскелета. Ремоделирование цитоскелета играет центральную роль в модуляции формы и миграции клеток. Филамин А, кодируемый геном FLNA, представляет собой широко экспрессируемый филамин, который регулирует реорганизацию актинового цитоскелета путем взаимодействия с интегринами, трансмембранными рецепторными комплексами и вторичными мессенджерами. [Предоставлено OMIM]^[7]

Структура

В состав белка входит актин связывающий N-концевой домен, 24 внутренних повтора и 2 шарнирные области.^[8][9]

Взаимодействия

Филамин показан взаимодействовать с:

• BRCA2,^[10]
• CD29^[11][12]
• CASR,^[13][14]
• FBLIM1,^[15]
• FILIP1,^[16]
• ЛНБ,^[17]
• НПХП1,^[18]
• РАЛА,^[19]
• SH2B3,^[20]
• ТРИО,^[21] и
• ВХЛ.^[22][23]

Редактирование РНК

Отредактированный остаток был ранее записан как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в dbSNP.

Тип

От А до Я Редактирование РНК катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины известны как гуанозин трансляционной машиной клеток. Есть три члена семейства ADAR, ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR 3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, комплементарной области сайта редактирования. Эта дополнительная область обычно находится в соседнем интрон но также может располагаться в экзонной последовательности. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая дополняющая последовательность (ECS).

Сайт

Один сайт редактирования пре-мРНК FLNA расположен в пределах аминокислоты 2341 конечного белка. В Глутамин (Q) кодон изменяется из-за дезаминирования аденозина в месте редактирования до Аргинин (R) кодон. Предполагается, что область редактирования будет образовывать двухцепочечную область длиной 32 пары оснований с комплементарной последовательностью примерно на 200 нуклеотидов ниже по ходу от сайта редактирования. Этот ECS находится в интронной последовательности.^[24] При редактировании на сайте Q / R, вероятно, будут задействованы как ADAR1, так и ADAR2. Нокауты ADAR2 мыши показывают уменьшение редактирования на сайте Q / R. Двойные нокауты ADAR1 не влияют на редактирование.^[25]

Структура

Отредактированный аденозин находится в 22 иммуноглулиноподобном повторе белка. Этот регион является интегрин β-связывающий домен^[26] и RAC1 связывающий домен.^[19] Замена аминокислоты, вероятно, повлияет на электростатический потенциал связывающих доменов.^[24] Сайт редактирования FLNA - это 2 нуклеотида от сайта сплайсинга, такого как сайт R / G GluR-2. Оба транскрипта имеют 7/8 идентичных нуклеотидов вокруг сайтов редактирования. Поскольку широко распространено мнение, что редактирование на сайте GLUR-2 Q / R влияет на сплайсинг, сходство последовательности и сайта редактирования может означать, что редактирование на сайте FLNA также может регулировать сплайсинг. Эксперименты in vitro с gluR-2 показали, что присутствие ADAR2 приводит к ингибированию сплайсинга.^[27] Анализ данных EST для FLNA показывает, что существует связь между редактированием последнего кодона экзона и сохранением следующего интрона.^[24]

Функция

Изменение электростатического потенциала, вероятно, повлияет на связывание FLNA со многими белками, с которыми она взаимодействует.^[28]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196924 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031328 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Горлин Дж. Б., Хенске Е., Уоррен С. Т., Кунст С. Б., Д'Урсо М., Пальмиери Дж., Хартвиг ​​Дж. Х., Брунс Дж., Квятковски Д. Д. (октябрь 1993 г.). «Актин-связывающий белок (ABP-280) ген филамина (FLN) отображает теломеру на локус цветового зрения (R / GCP) и центромеру на G6PD в Xq28». Геномика. 17 (2): 496–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1354. PMID  8406501.
6. Робертсон С.П., Твигг С.Р., Сазерленд-Смит А.Дж., Бьянкалана В., Горлин Р.Дж., Хорн Д., Кенврик С.Дж., Ким К.А., Морава Е., Ньюбери-Экоб Р., Орставик К.Х., Куоррелл О.В., Шварц К.Э., ножницы DJ, Сури М., Кендрик -Джонс Дж., Уилки А.О. (март 2003 г.). «Локальные мутации в гене, кодирующем цитоскелетный белок филамин А, вызывают различные пороки развития у людей». Нат Жене. 33 (4): 487–91. Дои:10,1038 / ng1119. PMID  12612583.
7. «Ген Entrez: FLNA филамин A, альфа (актин-связывающий белок 280)».
8. Гребер П., Витт HT (февраль 1976 г.). «Отношения между электрическим потенциалом, градиентом pH, потоком протонов и фосфорилированием в фотосинтетической мембране». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 423 (2): 141–63. Дои:10.1016/0005-2728(76)90174-2. PMID  2316.
9. "P21333 (FLNA_HUMAN): Филамин-А". UniProt.
10. Юань Ю, Шэнь Зи (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие с BRCA2 предполагает роль филамина-1 (hsFLNa) в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. 276 (51): 48318–24. Дои:10.1074 / jbc.M102557200. PMID  11602572.
11. ван дер Флиер А., Куйкман И., Крамер Д., Гертс Д., Крефт М., Такафута Т., Шапиро С. С., Зонненберг А. (январь 2002 г.). «Различные варианты сплайсинга филамина-B влияют на миогенез, субклеточное распределение и определяют связывание с субъединицами интегрина β». J. Cell Biol. 156 (2): 361–76. Дои:10.1083 / jcb.200103037. ЧВК  2199218. PMID  11807098.
12. Loo DT, Kanner SB, Aruffo A (сентябрь 1998 г.). «Филамин связывается с цитоплазматическим доменом бета1-интегрина. Идентификация аминокислот, ответственных за это взаимодействие». J. Biol. Chem. 273 (36): 23304–12. Дои:10.1074 / jbc.273.36.23304. PMID  9722563.
13. Hjälm G, MacLeod RJ, Kifor O, Chattopadhyay N, Brown EM (сентябрь 2001 г.). «Филамин-А связывается с карбоксильным концом рецептора, чувствительного к кальцию, взаимодействие, которое участвует в опосредованной CaR активации митоген-активируемой протеинкиназы». J. Biol. Chem. 276 (37): 34880–7. Дои:10.1074 / jbc.M100784200. PMID  11390380.
14. Авата Х., Хуанг С., Хандлогтен МЭ, Миллер РТ (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие рецептора, чувствительного к кальцию, и филамина, потенциального каркасного белка». J. Biol. Chem. 276 (37): 34871–9. Дои:10.1074 / jbc.M100775200. PMID  11390379.
15. Ту И, Ву С., Ши Х, Чен К., Ву Ц. (апрель 2003 г.). «Мигфилин и Mig-2 связывают фокальные адгезии с филамином и актиновым цитоскелетом и действуют в модуляции формы клеток». Клетка. 113 (1): 37–47. Дои:10.1016 / s0092-8674 (03) 00163-6. PMID  12679033.
16. Нагано Т., Йонеда Т., Хатанака И., Кубота С., Мураками Ф., Сато М. (июль 2002 г.). «Белок, взаимодействующий с филамином А (FILIP), регулирует миграцию кортикальных клеток из зоны желудочков». Nat. Cell Biol. 4 (7): 495–501. Дои:10.1038 / ncb808. PMID  12055638.
17. Шин В.Л., Фен Й., Грэм Д., Такафута Т., Шапиро С.С., Уолш, Калифорния (ноябрь 2002 г.). «Филамин А и филамин В совместно экспрессируются в нейронах в периоды миграции нейронов и могут физически взаимодействовать». Гм. Мол. Genet. 11 (23): 2845–54. Дои:10.1093 / hmg / 11.23.2845. PMID  12393796.
18. Дональдсон JC, Dise RS, Ричи MD, Хэнкс SK (август 2002 г.). «Нефроцистин-консервативные домены, участвующие в нацеливании на эпителиальные межклеточные соединения, взаимодействии с филаминами и установлении клеточной полярности». J. Biol. Chem. 277 (32): 29028–35. Дои:10.1074 / jbc.M111697200. PMID  12006559.
19. Охта Ю., Сузуки Н., Накамура С., Хартвиг ​​Дж. Х., Штоссель Т. П. (март 1999 г.). «Малая GTPase RalA нацелена на филамин, чтобы вызвать филоподии». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (5): 2122–8. Bibcode:1999PNAS ... 96.2122O. Дои:10.1073 / pnas.96.5.2122. ЧВК  26747. PMID  10051605.
20. Хэ Икс, Ли У, Шембри-Кинг Дж, Джейкс С., Хаяши Дж. (Август 2000 г.). «Идентификация актин-связывающего белка, ABP-280, в качестве партнера по связыванию адаптивного белка Lnk человека». Мол. Иммунол. 37 (10): 603–12. Дои:10.1016 / s0161-5890 (00) 00070-5. PMID  11163396.
21. Белланджер Дж. М., Астье С., Сардет С., Охта Ю., Штоссель Т. П., Дебант А. (декабрь 2000 г.). «Rac1- и RhoG-специфический домен GEF Trio нацелен на филамин для ремоделирования актина цитоскелета». Nat. Cell Biol. 2 (12): 888–92. Дои:10.1038/35046533. PMID  11146652.
22. Цучия Х, Иседа Т, Хино О (июль 1996 г.). «Идентификация связывания нового белка (VBP-1) с продуктом гена-супрессора опухоли фон Хиппеля-Линдау (VHL)». Рак Res. 56 (13): 2881–5. PMID  8674032.
23. Чжоу М.И., Ван Х., Росс Дж. Дж., Кузьмин И., Сюй С., Коэн Х. Т. (октябрь 2002 г.). «Подавитель опухолей фон Хиппеля-Линдау стабилизирует новый растительный гомеодоменный белок Jade-1». J. Biol. Chem. 277 (42): 39887–98. Дои:10.1074 / jbc.M205040200. PMID  12169691.
24. Леванон Э.Ю., Халлеггер М., Кинар Ю., Шемеш Р., Джинович-Каруго К., Рехави Г., Янч М.Ф., Айзенберг Э. (2005). «Эволюционно консервативные человеческие мишени от аденозина до редактирования РНК инозина». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (4): 1162–8. Bibcode:2005q.bio ..... 2045L. Дои:10.1093 / нар / gki239. ЧВК  549564. PMID  15731336.
25. Ридманн Е.М., Шопофф С., Хартнер Дж. К., Янч М. Ф. (июнь 2008 г.). «Специфика ADAR-опосредованного редактирования РНК в недавно идентифицированных мишенях». РНК. 14 (6): 1110–8. Дои:10.1261 / rna.923308. ЧВК  2390793. PMID  18430892.
26. Трэвис М.А., ван дер Флиер А., Каммерер Р.А., Молд А.П., Зонненберг А., Хамфрис М.Дж. (июль 2004 г.). «Взаимодействие филамина А с цитоплазматическим доменом интегрина бета 7: роль альтернативного сплайсинга и фосфорилирования». FEBS Lett. 569 (1–3): 185–90. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.04.099. PMID  15225631.
27. Братт Э., Оман М (март 2003 г.). «Координация редактирования и сплайсинга пре-мРНК рецептора глутамата». РНК. 9 (3): 309–18. Дои:10.1261 / rna.2750803. ЧВК  1370398. PMID  12592005.
28. Попович Г.М., Мюллер Р., Ноегель А.А., Шлейхер М., Хубер Р., Холак Т.А. (октябрь 2004 г.). «Молекулярная структура стержневого домена филамина диктиостелия». J. Mol. Биол. 342 (5): 1637–46. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.08.017. PMID  15364587.

дальнейшее чтение

• Light S, Sagit R, Ithychanda SS, Qin J, Elofsson A (сентябрь 2012 г.). «Эволюция филамина - перспектива повтора белкового домена». Журнал структурной биологии. 179 (3): 289–98. Дои:10.1016 / j.jsb.2012.02.010. ЧВК  3728663. PMID  22414427.
• Стоссель Т.П., Кондилис Дж., Кули Л., Хартвиг ​​Дж. Х., Ноегель А., Шлейхер М., Шапиро СС (2001). «Филамины как интеграторы клеточной механики и передачи сигналов». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 2 (2): 138–45. Дои:10.1038/35052082. PMID  11252955.
• ван дер Флиер А, Зонненберг А (2001). «Структурно-функциональные аспекты филаминов». Биохим. Биофиз. Acta. 1538 (2–3): 99–117. Дои:10.1016 / S0167-4889 (01) 00072-6. PMID  11336782.

внешняя ссылка

• Статья GeneReview / NCBI / NIH / UW о заболеваниях отопалатодигитального спектра
• GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о Х-связанной перивентрикулярной гетеротопии или двусторонней перивентрикулярной узловой гетеротопии