Кератин 7 - Keratin 7

KRT7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4XIF
Идентификаторы
Псевдонимы	KRT7, CK7, K2C7, K7, SCL, кератин 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 148059 MGI: 96704 ГомолоГен: 4058 Генные карты: KRT7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.13 Начинать 52,232,520 бп[1] Конец 52,252,186 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • структурная молекулярная активность Сотовый компонент • цитоплазма • кератиновая нить • внеклеточная экзосома • промежуточная нить • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • GO: 0022415 вирусный процесс • ороговение • ороговение Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3855	110310
Ансамбль	ENSG00000135480	ENSMUSG00000023039
UniProt	P08729	Q9DCV7
RefSeq (мРНК)	NM_005556	NM_033073
RefSeq (белок)	NP_005547	NP_149064
Расположение (UCSC)	Chr 12: 52.23 - 52.25 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кератин, цитоскелет II типа 7 также известный как цитокератин-7 (СК-7) или кератин-7 (K7) или сарколектин (SCL) - это белок что у людей кодируется KRT7 ген.^[4][5][6] Кератин 7 - это кератин II типа. Это особенно выражено в простом эпителий облицовка полостей внутренних органы и в протоках желез и кровеносный сосуд.

Функция

Кератин-7 входит в состав кератин генная семья. Цитокератины типа II состоят из основных или нейтральных белков, которые расположены в парах гетеротипических цепей кератина, коэкспрессируемых во время дифференцировки простых и многослойных эпителиальных тканей. Этот цитокератин типа II специфически экспрессируется в простом эпителии, выстилающем полости внутренних органов, а также в протоках желез и кровеносных сосудах. Гены, кодирующие цитокератины типа II, сгруппированы в области хромосомы 12q12-q13. Альтернативный сплайсинг может привести к нескольким вариантам транскрипта; однако не все варианты описаны полностью.^[6]

Кератин-7 содержится в простых железистых эпителий, И в переходный эпителий. Эпителиальные клетки легких и груди содержат кератин-7, но некоторые другие железистые эпителии, такие как эпителий толстой кишки и предстательная железа, не. Потому что кератин-7 антиген содержится как в здоровых, так и неопластический клетки, антитела к CK7 могут быть использованы в иммуногистохимия отличить яичник и переходно-клеточные карциномы (положительное окрашивание) от рака толстой кишки и рака простаты (отрицательное) соответственно. Обычно используется вместе с CK20 при постановке таких диагнозов.^[7]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции KRT7. Условный нокаутирующая мышь линия называется Krt7^{tm1b (КОМП) Wtsi} был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.^[8] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг^[9] для определения последствий удаления.^{[10][11][12][13]} Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование^[14]

Krt7 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Все данные доступны на сайте.[9][14]
Инсулин	Нормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14	Нормальный
Гомозиготная фертильность	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология 16 недель	Нормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недель	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный
Иммунофенотипирование селезенки	Нормальный
Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узлов	Нормальный
Состав эпидермального иммунитета	Нормальный
Проблема гриппа	Нормальный

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135480 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Розенберг М., Фукс Э., Ле Бо М.М., Эдди Р.Л., показывает ТБ (август 1991 г.). «Три эпидермальных и один простой эпителиальный кератиновый ген типа II отображаются на хромосоме 12 человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 57 (1): 33–8. Дои:10.1159/000133109. PMID  1713141.
5. Schweizer J, Bowden PE, Coulombe PA, Langbein L, Lane EB, Magin TM, Maltais L, Omary MB, Parry DA, Rogers MA, Wright MW (июль 2006 г.). «Новая согласованная номенклатура кератинов млекопитающих». Журнал клеточной биологии. 174 (2): 169–74. Дои:10.1083 / jcb.200603161. ЧВК  2064177. PMID  16831889.
6. "Entrez Gene: KRT7 кератин 7".
7. Леонг, Энтони С-И; Купер, Кумарасон; Леонг, Ф. Джоэл W-M (2003). Руководство по диагностической цитологии (2-е изд.). Гринвич Медикал Медиа, Лтд. Стр. 173. ISBN  978-1-84110-100-2.
8. Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
9. «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
10. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
11. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
12. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
13. Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингам Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
14. «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение

• Bouwens L (март 1998 г.). «Цитокератины и дифференцировка клеток в поджелудочной железе». Журнал патологии. 184 (3): 234–9. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-9896 (199803) 184: 3 <234 :: AID-PATH28> 3.0.CO; 2-D. PMID  9614373.
• Гласс С., Ким К. Х., Фукс Э. (декабрь 1985 г.). «Последовательность и экспрессия мезотелиального кератина человека II типа». Журнал клеточной биологии. 101 (6): 2366–73. Дои:10.1083 / jcb.101.6.2366. ЧВК  2114014. PMID  2415537.
• Ramaekers F, Huysmans A, Schaart G, Moesker O, Vooijs P (май 1987 г.). «Распределение кератина 7 в тканях, контролируемое моноклональными антителами». Экспериментальные исследования клеток. 170 (1): 235–49. Дои:10.1016/0014-4827(87)90133-9. PMID  2436934.
• Glass C, Fuchs E (октябрь 1988 г.). «Выделение, последовательность и дифференциальная экспрессия гена К7 человека в простых эпителиальных клетках». Журнал клеточной биологии. 107 (4): 1337–50. Дои:10.1083 / jcb.107.4.1337. ЧВК  2115265. PMID  2459129.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Gress TM, Müller-Pillasch F, Geng M, Zimmerhackl F, Zehetner G, Friess H, Büchler M, Adler G, Lehrach H (октябрь 1996 г.). «Профиль экспрессии, специфичный для рака поджелудочной железы». Онкоген. 13 (8): 1819–30. PMID  8895530.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Альварес Альварес К., Санчес Мерино Дж. М., Бусто Кастаньон Л., Помбо Фелипе Ф., Арнал Монреаль Ф (июнь 1998 г.). «[Муцинозная аденокарцинома ураха, синхронная с колоректальной аденокарциномой. Значение иммуногистохимии в дифференциальной диагностике]». Actas Urologicas Españolas. 22 (6): 515–8. PMID  9734130.
• Каба А., Цзян PH, Чани-Фурнье Ф, Чани С. (июль 1999 г.). «Сарколектин (SCL): структура и экспрессия рекомбинантной молекулы». Биохимия. 81 (7): 709–15. Дои:10.1016 / S0300-9084 (99) 80128-X. PMID  10492017.
• Линь Л., Холбро Т., Алонсо Дж., Героса Д., Бургер М.М. (2001). «Молекулярное взаимодействие между белком-маркером опухоли человека p150, крупнейшей субъединицей eIF3, и белком промежуточного филамента K7». Журнал клеточной биохимии. 80 (4): 483–90. Дои:10.1002 / 1097-4644 (20010315) 80: 4 <483 :: AID-JCB1002> 3.0.CO; 2-B. PMID  11169732.
• Сузуки Х, Фукуниси Й, Кагава И., Сайто Р., Ода Х, Эндо Т, Кондо С., Боно Х, Окадзаки Й, Хаяшизаки Й (октябрь 2001 г.). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши». Геномные исследования. 11 (10): 1758–65. Дои:10.1101 / гр.180101. ЧВК  311163. PMID  11591653.
• Харрис Р.А., Ян А., Стейн Р.К., Люси К., Брустен Л., Херат А., Парек Р., Уотерфилд, доктор медицины, О'Хара М.Дж., Невилл М.А., Пейдж М.Дж., Звелебил М.Дж. (февраль 2002 г.). «Кластерный анализ обширной базы данных карт экспрессии белка клеточной линии рака груди человека». Протеомика. 2 (2): 212–23. Дои:10.1002 / 1615-9861 (200202) 2: 2 <212 :: AID-PROT212> 3.0.CO; 2-H. PMID  11840567.
• Бонвини П., Гастальди Т., Фалини Б., Розолен А. (март 2002 г.). «Нуклеофозмин-анапластическая киназа лимфомы (NPM-ALK), новая тирозинкиназа клиента Hsp90: подавление экспрессии NPM-ALK и фосфорилирования тирозина в клетках лимфомы ALK (+) CD30 (+) антагонистом Hsp90 17-аллиламино, 17-деметоксигельданамицин ». Исследования рака. 62 (5): 1559–66. PMID  11888936.
• Йованович И., Царди М., Музас И.А., Мичев М., Песко П., Милосавлевич Т., Зойс М., Сганзос М., Делидес Г., Канаварос П. (апрель 2002 г.). «Изменение паттерна экспрессии цитокератина 7 и 20 от нормального эпителия до кишечной метаплазии слизистой оболочки желудка и гастроэзофагеального перехода». Гистология и гистопатология. 17 (2): 445–54. PMID  11962749.
• Kanduc D (июль 2002 г.). «Регулирование трансляции мРНК E7 вируса папилломы человека типа 16 пептидом SEQIKA, общим для альфа (1) -глобина кролика и цитокератина 7 человека». Журнал вирусологии. 76 (14): 7040–8. Дои:10.1128 / JVI.76.14.7040-7048.2002. ЧВК  136328. PMID  12072504.
• Смит Ф.Дж., Портер Р.М., Корден Л.Д., Ланни Д.П., Лейн Э.Б., Маклин У.Х. (октябрь 2002 г.). «Клонирование человеческого, мышиного и сумчатого кератина 7 и исследование экспрессии K7 у мышей». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 297 (4): 818–27. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02288-X. PMID  12359226.
• Благоев Б., Кратчмарова И., Онг С.Е., Нильсен М., Фостер Л.Дж., Манн М. (март 2003 г.). «Протеомическая стратегия для выяснения функциональных белок-белковых взаимодействий, применяемая к передаче сигналов EGF». Природа Биотехнологии. 21 (3): 315–8. Дои:10.1038 / nbt790. PMID  12577067. S2CID  26838266.