FOXD3 - FOXD3

FOXD3
Идентификаторы
Псевдонимы	FOXD3, AIS1, Genesis, HFH2, VAMAS2, вилка D3
Внешние идентификаторы	OMIM: 611539 MGI: 1347473 ГомолоГен: 49239 Генные карты: FOXD3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п31.3 Начинать 63,322,567 бп[1] Конец 63,325,128 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 C6 | 4 45,71 см Начинать 99,656,299 бп[2] Конец 99,658,622 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядерный хроматин • ядро клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • поддержание популяции соматических стволовых клеток • внутриутробное эмбриональное развитие • транскрипция, ДНК-шаблон • морфогенез анатомической структуры • дифференциация клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27022	15221
Ансамбль	ENSG00000187140	ENSMUSG00000067261
UniProt	Q9UJU5	Q61060
RefSeq (мРНК)	NM_012183	NM_010425
RefSeq (белок)	NP_036315	NP_034555
Расположение (UCSC)	Chr 1: 63.32 - 63.33 Мб	Chr 4: 99,66 - 99,66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коробка вилочная D3 также известный как FOXD3 это белок вилки что у людей кодируется FOXD3 ген.^[5]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству белков вилки. факторы транскрипции который характеризуется ДНК-связывающей вилкой домен. FoxD3 функционирует как репрессор транскрипции и содержит закрепленный на С-конце мотив гомологии-1 (eh1), который обеспечивает интерактивную поверхность с транскрипционным ко-репрессором Grg4 (родственный Groucho ген-4).^[6]

Стволовые клетки

Многочисленные исследования подтвердили участие Foxd3 в переходе от наивных плюрипотентных стволовых клеток к праймированным в развитии эмбрионов. Ранее было продемонстрировано, что Foxd3 необходим для поддержания плюрипотентности у мышей. эмбриональные стволовые клетки.^[7] Недавнее открытие также показало, что Foxd3 необходим в качестве репрессора при переходе от ESC к эпибластоподобным клеткам (EpiLC).^[8] В исследовании было высказано предположение, что Foxd3 связан с инактивацией важных наивных генов плюрипотентности путем модификации структур хроматина посредством привлечения гистоновых деметилаз и уменьшения количества активирующих факторов. Другой предложенный механизм, с другой стороны, утверждал, что Foxd3 начинает удаление нуклеосом и индукцию до «примированного» плюрипотентного состояния путем привлечения Brg1, ремоделирующий нуклеосомы, а затем действует как репрессор максимальной активации этих энхансеров, привлекая гистоновые деацетилазы, предполагая сложную опосредованную функцию, при которой энхансеры настраиваются на некоторый будущий контролируемый момент времени, а не на немедленную экспрессию.^[9] Хотя нет никакой двусмысленности в том, что Foxd3 играет важную роль в регулировании перехода от наивного к заряженному состоянию плюрипотентности, эти две модели показывают разные процессы. Попытки согласовать выводы двух исследований дополнительно показали, что Foxd3 функционирует так же, как и все вышеперечисленное.^[10]

Клиническое значение

Мутации в этом гене вызывают витилиго.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000187140 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067261 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хромас Р., Мур Дж., Джонстон Т., Соча С., Клемш М. (июнь 1993 г.). «Гомологи вилочной головки дрозофилы экспрессируются ограниченным по клону способом в гемопоэтических клетках человека». Кровь. 81 (11): 2854–9. Дои:10.1182 / blood.V81.11.2854.2854. PMID  8499623.
6. Якличкин С., Штайнер А.Б., Лу К., Кесслер Д.С. (2007). «FoxD3 и Grg4 физически взаимодействуют, подавляя транскрипцию и индуцируя мезодерму у Xenopus». J Biol Chem. 282 (4): 2548–5. Дои:10.1074 / jbc.M607412200. ЧВК  1780074. PMID  17138566.
7. Ханна Л.А., Бригадир Р.К., Тарасенко И.А., Кесслер Д.С., Лабоский П.А. (2002). «Потребность в Foxd3 для поддержания плюрипотентных клеток раннего эмбриона мыши». Genes Dev. 16 (20): 2650–61. Дои:10.1101 / гад.1020502. ЧВК  187464. PMID  12381664.
8. Респуэла П., Николич М., Тан М., Фроммольт П., Чжао Ю., Высоцка Дж., Рада-Иглесиас А. (2016). «Foxd3 способствует выходу из наивной плюрипотентности путем вывода из эксплуатации усилителя и запрещает спецификацию зародышевой линии». Стволовая клетка. 18 (1): 118–33. Дои:10.1016 / j.stem.2015.09.010. ЧВК  5048917. PMID  26748758.
9. Кришнакумар Р., Чен А.Ф., Пантович М.Г., Даниал М., Парчем Р.Дж., Лабоски П.А., Блеллох Р. (2016). «FOXD3 регулирует потенциал плюрипотентных стволовых клеток, одновременно инициируя и подавляя энхансерную активность». Стволовая клетка. 18 (1): 104–17. Дои:10.1016 / j.stem.2015.10.003. ЧВК  4775235. PMID  26748757.
10. Планк-Базинет Дж. Л., Манделл Н. А. (2016). «Парадокс Foxd3: как он участвует в плюрипотентности и дифференцировке эмбриональных стволовых клеток?». Исследование стволовых клеток. 3: 73. Дои:10.21037 / sci.2016.09.20. ЧВК  5104585. PMID  27868055.
11. Алхатиб А., Файн PR, Spritz RA (август 2005 г.). «Возможный вариант функционального промотора в гене регулятора развития меланобластов FOXD3 при аутосомно-доминантном витилиго». J. Invest. Дерматол. 125 (2): 388–91. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2005.23822.x. PMID  16098053.

дальнейшее чтение

• Guo Y, Costa R, Ramsey H, et al. (2002). «Факторы транскрипции эмбриональных стволовых клеток Oct-4 и FoxD3 взаимодействуют для регулирования экспрессии энтодермального промотора». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (6): 3663–7. Дои:10.1073 / pnas.062041099. ЧВК  122580. PMID  11891324.
• Леви Д., Ларсон М.Г., Бенджамин Э.Дж. и др. (2007). «Проект Framingham Heart Study 100K: общегеномные ассоциации кровяного давления и жесткости артерий». BMC Med. Genet. 8 Приложение 1: S3. Дои:10.1186 / 1471-2350-8-S1-S3. ЧВК  1995621. PMID  17903302.
• Салем Р.А., Банерджи-Басу С., Берри Ф. Б. и др. (2001). «Анализ влияния болезнетворных миссенс-мутаций на структуру и функцию белка крылатой спирали FOXC1». Американский журнал генетики человека. 68 (3): 627–41. Дои:10.1086/318792. ЧВК  1274476. PMID  11179011.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Буешер Дж. Л., Мартинес Л. Б., Сато С. и др. (2009). «YY1 и FoxD3 регулируют активацию промотора OTK18 антиретровирусного белка цинкового пальца, индуцированную ВИЧ-1 инфекцией». J Neuroimmune Pharmacol. 4 (1): 103–15. Дои:10.1007 / s11481-008-9139-x. ЧВК  2680142. PMID  19034670.