SOX15 - SOX15

SOX15
Идентификаторы
Псевдонимы	SOX15, SOX20, SOX26, SOX27, SRY-бокс 15, фактор транскрипции SRY-box 15
Внешние идентификаторы	OMIM: 601297 MGI: 98363 ГомолоГен: 74586 Генные карты: SOX15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.1 Начинать 7,588,178 бп[1] Конец 7,590,094 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B3 | 11 42,86 см Начинать 69,655,314 бп[2] Конец 69,656,727 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки Биологический процесс • положительное регулирование пролиферации миобластов • дифференциация клеток • развитие мужских гонад • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция активации сателлитных клеток, участвующих в регенерации скелетных мышц • отрицательная регуляция развития поперечно-полосатой мышечной ткани • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительное регулирование перехода G0 в G1 • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • организация хроматина • развитие миобластов • регенерация ткани скелетных мышц • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие центральной нервной системы • дифференциация нейронов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6665	20670
Ансамбль	ENSG00000129194	ENSMUSG00000041287
UniProt	O60248	P43267
RefSeq (мРНК)	NM_006942	NM_009235
RefSeq (белок)	NP_008873	NP_033261
Расположение (UCSC)	Chr 17: 7.59 - 7.59 Мб	Chr 11: 69.66 - 69.66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок SOX-15 это белок что у людей кодируется SOX15 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует члена семейства транскрипционных факторов SOX (SRY-related HMG-box), участвующих в регуляции эмбрионального развития и в определении судьбы клетки. Кодируемый белок может действовать как регулятор транскрипции после образования белкового комплекса с другими белками.^[7]

Смотрите также

• SOX гены

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129194 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041287 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мейер Дж., Вирт Дж., Хелд М., Шемпп В., Шерер Дж. (Январь 1997 г.). «SOX20, новый член семейства генов SOX, расположен на хромосоме 17p13». Cytogenet Cell Genet. 72 (2–3): 246–9. Дои:10.1159/000134200. PMID  8978787.
6. Кричер Р., Ститсон Р., Уэйд-Мартинс Р., Исти Д. Д., Фарр С. Джей (октябрь 1998 г.). «Отнесение Sox4 к полосам A3-A5 хромосомы 13 мыши путем флуоресцентной гибридизации in situ; уточнение местоположения SOX4 человека в 6p22.3 и SOX20 в хромосоме 17p12.3». Cytogenet Cell Genet. 81 (3–4): 294–5. Дои:10.1159/000015052. PMID  9730625. S2CID  46849443.
7. "Entrez Gene: SOX15 SRY (область определения пола Y) -box 15".

дальнейшее чтение

• Уилсон М, Купман П (2003). «Соответствие SOX: белки-партнеры и кофакторы семейства SOX регуляторов транскрипции». Curr. Мнение. Genet. Dev. 12 (4): 441–6. Дои:10.1016 / S0959-437X (02) 00323-4. PMID  12100890.
• Schepers GE, Teasdale RD, Koopman P (2002). «Двадцать пар sox: степень, гомология и номенклатура семейств генов фактора транскрипции sox мыши и человека». Dev. Клетка. 3 (2): 167–70. Дои:10.1016 / S1534-5807 (02) 00223-X. PMID  12194848.
• Гозе С., Пулат Ф, Берта П. (1993). «Частичное клонирование SOX-11 и SOX-12, двух новых человеческих генов SOX». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (12): 2943. Дои:10.1093 / nar / 21.12.2943. ЧВК  309692. PMID  8332506.
• Хираока Ю., Огава М., Сакаи Ю. и др. (1998). «Выделение и экспрессия кДНК человека, относящейся к SRY, hSOX20». Биохим. Биофиз. Acta. 1396 (2): 132–7. Дои:10.1016 / s0167-4781 (97) 00186-3. PMID  9540826.
• Кремази Ф, Сулье С., Берта П., Джей П. (1998). «Дальнейшая сложность семейства генов SOX человека, выявленная комбинированным использованием сильно вырожденных праймеров и вложенной ПЦР». FEBS Lett. 438 (3): 311–4. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 01294-0. PMID  9827568. S2CID  551497.
• Вуич М., Райич Т., Гудфеллоу П.Н., Стеванович М. (1999). «Характеристика кДНК и картирование с высоким разрешением человеческого гена SOX20». Мамм. Геном. 9 (12): 1059–61. Дои:10.1007 / s003359900925. PMID  9880678. S2CID  792477.
• Мияшита А., Симидзу Н., Эндо Н. и др. (1999). «Пять различных генов, Eif4a1, Cd68, Supl15h, Sox15 и Fxr2h, сгруппированы в области 40 т.п.н. хромосомы 11 мыши». Ген. 237 (1): 53–60. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00301-7. PMID  10524236.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.