DPF2 - DPF2

DPF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3IUF
Идентификаторы
Псевдонимы	DPF2, REQ, UBID4, ubi-d4, двойные пальцы PHD 2, CSS7
Внешние идентификаторы	OMIM: 601671 MGI: 109529 ГомолоГен: 21265 Генные карты: DPF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начинать 65,333,852 бп[1] Конец 65,354,262 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 А | 19 4,34 см Начинать 5,896,516 бп[2] Конец 5,913,010 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • активность гистонацетилтрансферазы • связывание гистонов • H3K9me3 модифицированное связывание гистонов • связывание лизин-ацетилированного гистона Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • центросома • ядерный хроматин • цитоплазма • цитозоль • гистонацетилтрансферазный комплекс • комплекс nBAF Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • апоптотический сигнальный путь • апоптотический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • организация хроматина • развитие нервной системы • ацетилирование гистонов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция дифференцировки миелоидных клеток-предшественников Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5977	19708
Ансамбль	ENSG00000133884	ENSMUSG00000024826
UniProt	Q92785	Q61103
RefSeq (мРНК)	NM_006268 NM_001330308	NM_001291078 NM_011262
RefSeq (белок)	NP_001317237 NP_006259 NP_006259.1	NP_001278007 NP_035392
Расположение (UCSC)	Chr 11: 65.33 - 65.35 Мб	Chr 19: 5.9 - 5.91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинк-пальцевый протеин ubi-d4 это белок что у людей кодируется DPF2 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства доменов d4, характеризующимся структурным мотивом, подобным цинковому пальцу. Этот белок функционирует как фактор транскрипции что необходимо для апоптотический реакция после лишения факторов выживания. Вероятно, он играет регулирующую роль в быстром кроветворный рост и обновление клеток. Этот ген считается геном-кандидатом в множественная эндокринная неоплазия I типа, унаследованный рак синдром, включающий несколько паращитовидная железа, энтеропанкреатический и гипофиз опухоли.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000133884 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024826 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нинкина Н.Н., Мерцалов И.Б., Куликова Д.А., Алимова-Кост М.В., Симонова О.Б., Корочкин Л.И., Киселев С.Л., Бухман В.Л. (фев 2002). «Cerd4, третий член семейства генов d4: экспрессия и организация геномного локуса». Геном мамм. 12 (11): 862–6. Дои:10.1007 / s00335-001-3039-1. PMID  11845289. S2CID  2149578.
6. «Entrez Gene: DPF2 D4, цинковые и двойные пальцы PHD, семейство 2».

дальнейшее чтение

• Габиг Т.Г., Мантел П.Л., Росли Р., Crean CD (1994). «Реквием: новый ген цинкового пальца, необходимый для апоптоза миелоидных клеток». J. Biol. Chem. 269 (47): 29515–9. PMID  7961935.
• Честков А.В., Бака И.Д., Кост М.В. и др. (1997). «Семейство генов d4 в геноме человека». Геномика. 36 (1): 174–7. Дои:10.1006 / geno.1996.0440. PMID  8812431.
• Гуру С.К., Агарвал С.К., Маникам П. и др. (1997). «Карта стенограммы для области 2,8 Mb, содержащей локус множественной эндокринной неоплазии 1 типа». Genome Res. 7 (7): 725–35. Дои:10.1101 / гр.7.7.725. ЧВК  310681. PMID  9253601.
• Габиг Т.Г., Крин С.Д., Кленк А. и др. (1998). «Экспрессия и хромосомная локализация гена Реквиема». Мамм. Геном. 9 (8): 660–5. Дои:10.1007 / s003359900840. PMID  9680388. S2CID  22559464.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Бауместер Т., Баух А., Раффнер Х. и др. (2004). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216. S2CID  11683986.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.

внешняя ссылка

• DPF2 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.