GABPB2 - GABPB2

GABPB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1AWC
Идентификаторы
Псевдонимы	GABPB1, BABPB2, E4TF1, E4TF1-47, E4TF1-53, E4TF1B, GABPB, GABPB2, NRF2B1, NRF2B2, GABPB-1, субъединица 1 фактора транскрипции GA связывающего белка, субъединица фактора транскрипции GA связывающего белка бета 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600610 MGI: 95611 ГомолоГен: 7723 Генные карты: GABPB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q21.2 Начните 50,275,392 бп[1] Конец 50,355,408 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 F1 | 2 61,76 см Начните 126,627,442 бп[2] Конец 126,676,337 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • активность гетеродимеризации белков • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазматическая гранула рибонуклеопротеина Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • митохондриальная организация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2553	14391
Ансамбль	ENSG00000104064	ENSMUSG00000027361
UniProt	Q06547	Q00420
RefSeq (мРНК)	NM_002041 NM_005254 NM_016654 NM_016655 NM_181427 NM_001320910 NM_001320915	NM_001271467 NM_001271468 NM_001271469 NM_001271470 NM_001271492 NM_010249 NM_207669 NM_001355108 NM_001355109
RefSeq (белок)	NP_001307839 NP_001307844 NP_002032 NP_005245 NP_057738 NP_057739 NP_852092 NP_057738.1	NP_001258396 NP_001258397 NP_001258398 NP_001258399 NP_001258421 NP_034379 NP_997552 NP_001342037 NP_001342038
Расположение (UCSC)	Chr 15: 50.28 - 50.36 Мб	Chr 2: 126.63 - 126.68 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица GA-связывающего белка бета-1 это белок что у людей кодируется GABPB1 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует фактор транскрипции GA-связывающего белка, бета-субъединицу. Этот белок образует тетрамерный комплекс с альфа-субъединицей и стимулирует транскрипцию генов-мишеней. Кодируемый белок может участвовать в активации экспрессии цитохромоксидазы и ядерном контроле функции митохондрий. Кристаллическая структура подобного белка у мыши была решена как тройной белковый комплекс. Для этого гена было идентифицировано множество вариантов транскриптов, кодирующих различные изоформы.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104064 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027361 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. de la Brousse FC, Birkenmeier EH, King DS, Rowe LB, McKnight SL (ноябрь 1994 г.). «Молекулярно-генетическая характеристика GABP beta». Genes Dev. 8 (15): 1853–65. Дои:10.1101 / gad.8.15.1853. PMID  7958862.
6. «Ген Entrez: фактор транскрипции GABPB2 GA, связывающий белок, бета-субъединица 2».

дальнейшее чтение

• Савада Дж., Гото М., Ватанабе Х. и др. (1995). «Региональное картирование двух субъединиц фактора транскрипции E4TF1 на хромосоме человека». Jpn. J. Cancer Res. 86 (1): 10–2. Дои:10.1111 / j.1349-7006.1995.tb02981.x. ЧВК  5920589. PMID  7737900.
• Гугнея С., Вирбасиус СП, Скарпулла Р.С. (1995). «Четыре структурно различных, не связывающихся с ДНК субъединицы ядерного респираторного фактора 2 человека имеют общий консервативный домен активации транскрипции». Мол. Cell. Биол. 15 (1): 102–11. Дои:10.1128 / MCB.15.1.102. ЧВК  231915. PMID  7799916.
• Вирбазиус СП, Вирбазий CA, Скарпулла RC (1993). «Идентичность GABP с NRF-2, мультисубъединичным активатором экспрессии цитохромоксидазы, показывает клеточную роль активатора ETS домена вирусных промоторов». Genes Dev. 7 (3): 380–92. Дои:10.1101 / gad.7.3.380. PMID  8383622.
• Ватанабе Х., Савада Дж., Яно К. и др. (1993). «Клонирование кДНК субъединиц фактора транскрипции E4TF1 с Ets и мотивами notch». Мол. Cell. Биол. 13 (3): 1385–91. Дои:10.1128 / MCB.13.3.1385. ЧВК  359448. PMID  8441384.
• Гугнея С., Вирбазиус С.М., Скарпулла Р.С. (1996). «Ядерные респираторные факторы 1 и 2 используют аналогичные глутамин-содержащие кластеры гидрофобных остатков для активации транскрипции». Мол. Cell. Биол. 16 (10): 5708–16. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5708. ЧВК  231571. PMID  8816484.
• Сава С., Гото М., Сузуки Ф. и др. (1997). «Функциональные домены фактора транскрипции hGABP beta1 / E4TF1-53, необходимые для ядерной локализации и активации транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (24): 4954–61. Дои:10.1093 / nar / 24.24.4954. ЧВК  146336. PMID  9016666.
• Sowa Y, Shiio Y, Fujita T и др. (1997). «Сайт фактора связывания 1 ретинобластомы в области корового промотора гена RB человека активируется hGABP / E4TF1». Рак Res. 57 (15): 3145–8. PMID  9242441.
• Бэтчелор А.Х., Пайпер Д.Е., де ла Брус Ф.К. и др. (1998). «Структура GABPalpha / beta: гетеродимер ETS-домена и анкиринового повтора, связанный с ДНК». Наука. 279 (5353): 1037–41. Bibcode:1998Sci ... 279.1037B. Дои:10.1126 / science.279.5353.1037. PMID  9461436.
• Сузуки Ф., Гото М., Сава С. и др. (1998). «Функциональные взаимодействия субъединиц человеческого GA-связывающего белка фактора транскрипции». J. Biol. Chem. 273 (45): 29302–8. Дои:10.1074 / jbc.273.45.29302. PMID  9792629.
• Савада Дж., Симидзу Н., Сузуки Ф. и др. (2000). «Синергетическая активация транскрипции с помощью hGABP и избранных членов семейства белков, связывающих фактор транскрипции / ответный элемент цАМФ». J. Biol. Chem. 274 (50): 35475–82. Дои:10.1074 / jbc.274.50.35475. PMID  10585419.
• Фогель JL, Кристи TM (2000). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции с помощью GABP». EMBO J. 19 (4): 683–90. Дои:10.1093 / emboj / 19.4.683. ЧВК  305606. PMID  10675337.
• Сава Ч., Йошикава Т., Мацуда-Судзуки Ф. и др. (2002). «YEAF1 / RYBP и YAF-2 являются функционально разными членами семейства кофакторов для факторов транскрипции YY1 и E4TF1 / hGABP». J. Biol. Chem. 277 (25): 22484–90. Дои:10.1074 / jbc.M203060200. PMID  11953439.
• Мари С., Race V, Nassogne MC и др. (2002). «Мутация сайта связывания ядерного респираторного фактора 2 в 5'-нетранслируемой области гена ADSL у трех пациентов с дефицитом аденилосукцинатлиазы». Am. J. Hum. Genet. 71 (1): 14–21. Дои:10.1086/341036. ЧВК  384970. PMID  12016589.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Jeong BC, Kim MY, Lee JH и др. (2006). «Специфический для мозга ингибитор ангиогенеза 2 регулирует VEGF через GABP, который действует как репрессор транскрипции». FEBS Lett. 580 (2): 669–76. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.12.086. PMID  16412436. S2CID  35468847.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.

внешние ссылки

• GABPB2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q00420 (Субъединица бета-1 GA-связывающего белка мыши) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.