RBPJ - RBPJ

RBPJ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2F8X, 3NBN, 3V79
Идентификаторы
Псевдонимы	RBPJ, AOS3, CBF1, IGKJRB, IGKJRB1, KBF2, RBP-J, RBPJK, RBPSUH, SUH, csl, белок связывания сигнала рекомбинации для области J иммуноглобулина каппа, RBP-J каппа, RBP-JK, CBF-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 147183 MGI: 96522 ГомолоГен: 7511 Генные карты: RBPJ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п15.2 Начните 26,163,455 бп[1] Конец 26,435,131 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 C1 | 5 29,37 см Начните 53,466,152 бп[2] Конец 53,657,362 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с N-концом белка • РНК-полимераза II репрессирует связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • рекомбиназная активность • связывание хроматина • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • активность фактора транскрипции, связывание с последовательностью проксимальной области корового промотора РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • последовательное связывание ДНК • связывание фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • репрессия связывания фактора транскрипции • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядрышко • Комплекс MAML1-RBP-Jkapp-ICN1 • комплекс регуляторов транскрипции • цитоплазма • ядро клетки • нуклеоплазма • транскрипционный репрессорный комплекс Биологический процесс • морфогенез артерии • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • дифференциация нейронов • Спецификация судьбы эпидермальных клеток • положительное регулирование пролиферации клеток • Дифференциация клеток Клары • поддержание популяции соматических стволовых клеток • развитие эндокарда • обязательство клеточной судьбы • Рекомбинация ДНК • сомитогенез • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию • защитный ответ на бактерию • регулирование времени дифференцировки клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гуморальный иммунный ответ • дифференцировка кератиноцитов • созревание волосяного фолликула • отрицательное регулирование пролиферации клеток • развитие гипофиза • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • Передача сигналов Notch участвует в развитии сердца • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция экспрессии генов • обязательство судьбы артериальных эндотелиальных клеток • миелоидная дифференцировка дендритных клеток • ремоделирование кровеносных сосудов • спецификация вторичного сердечного поля • регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие сальных желез • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt, участвующего в обязательстве судьбы клеток сердечной мышцы • воспалительный ответ на антигенный раздражитель • развитие сердца • предопределение судьбы слуховых рецепторов • Дифференцировка В-клеток • регуляция экспрессии генов • Notch сигнальный путь • морфогенез дорсальной аорты • развитие атриовентрикулярного канала • положительная регуляция сигнального пути рецептора эфрина • переход эпителия в мезенхиму, участвующий в формировании эндокардиальной подушки • морфогенез тракта оттока • морфогенез левого желудочка сердца • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие кровеносных сосудов лабиринтного слоя • люменизация кровеносных сосудов • морфогенез эндокарда • морфогенез миокарда трабекулы желудочков • отрицательное регулирование окостенения • положительная регуляция пролиферации клеток, участвующих в морфогенезе сердца • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в дифференцировке клеток-предшественников миокарда • положительное регулирование пролиферации клеток сердечной мышцы • ангиогенез • эпителиально-мезенхимальный переход • положительная регуляция сигнального пути BMP • положительная регуляция сигнального пути ERBB • спецификация судьбы эндотелиальных клеток кровеносных сосудов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции мишени рецептора Notch • положительная регуляция сигнального пути Notch • кроветворение • развитие аортального клапана • развитие клапана легочной артерии • морфогенез межжелудочковой перегородки • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3516	19664
Ансамбль	ENSG00000168214	ENSMUSG00000039191
UniProt	Q06330	P31266
RefSeq (мРНК)	NM_005349 NM_015874 NM_203283 NM_203284 NM_001363577 NM_001374400 NM_001374401 NM_001374402 NM_001374403 NM_001379406 NM_001379407 NM_001379408 NM_001379409	NM_001080927 NM_001080928 NM_001277116 NM_009035 NM_001359152
RefSeq (белок)	NP_005340 NP_056958 NP_976028 NP_976029 NP_001350506 NP_001361329 NP_001361330 NP_001361331 NP_001361332 NP_001366335 NP_001366336 NP_001366337 NP_001366338	NP_001074396 NP_001074397 NP_001264045 NP_033061 NP_001346081
Расположение (UCSC)	Chr 4: 26.16 - 26.44 Мб	Chr 5: 53,47 - 53,66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий сигнал рекомбинации для J-области каппа иммуноглобулина это белок что у людей кодируется RBPJ ген.^[5][6][7]

RBPJ^[8] также известный как CBF1, является человеческим гомологом Дрозофила ген Подавитель безволосого. это промоутер регион обычно используется для демонстрации Notch1 сигнализация.^[9]

Взаимодействия

RBPJ было показано взаимодействовать с участием:

• NOTCH1^[10][11]
• NCOR2,^[12][13]
• PCAF,^[14]
• SND1,^[15][16] и
• SNW1.^[15][17]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168214 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039191 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Амакава Р., Цзин В., Одзава К., Мацунами Н., Хамагути Ю., Мацуда Ф., Кавайчи М., Хондзё Т. (август 1993 г.). «Ген белка связывания сигнала рекомбинации Jk человека (IGKJRB): сравнение с его гомологом мыши». Геномика. 17 (2): 306–15. Дои:10.1006 / geno.1993.1326. PMID  8406481.
6. Тан Х, Сайто-Охара Ф, Сонг Дж, Кога К., Угай Х, Мураками Х, Икеучи Т, Йокояма К.К. (июнь 1997 г.). «Присвоение человеческого гена KBF2 / RBP-Jk хромосомам 9p12-13 и 9q13 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Японский журнал генетики человека. 42 (2): 337–41. Дои:10.1007 / BF02766956. PMID  9290259.
7. «Ген NCBI: белок связывания сигнала рекомбинации RBPJ для области J иммуноглобулина каппа».
8. "HGNC: Отчет по символам RBPJ".
9. Шей Дж. Дж., Хенкель Т., Сэлмон П., Роби Э., Петерсон М. Г., Хейворд С. Д. (март 1996 г.). «Усеченный Notch1 млекопитающих активирует гены, репрессированные CBF1 / RBPJk, по механизму, напоминающему механизм EBNA2 вируса Эпштейна-Барра». Молекулярная и клеточная биология. 16 (3): 952–9. Дои:10.1128 / mcb.16.3.952. ЧВК  231077. PMID  8622698.
10. Нам Й., Вен А. П., Астер Дж. К., Блэклоу СК (июнь 2003 г.). «Структурные требования для сборки CSL.intracellular Notch1.Mastermind-like 1 комплекса транскрипционной активации». Журнал биологической химии. 278 (23): 21232–9. Дои:10.1074 / jbc.M301567200. PMID  12644465.
11. Астер Дж. К., Робертсон Е. С., Хассерджян Р. П., Тернер Дж. Р., Кифф Е., Склар Дж. (Апрель 1997 г.). «Онкогенные формы NOTCH1, лишенные первичного сайта связывания для RBP-Jkappa или последовательностей ядерной локализации, сохраняют способность связываться с RBP-Jkappa и активировать транскрипцию». Журнал биологической химии. 272 (17): 11336–43. Дои:10.1074 / jbc.272.17.11336. PMID  9111040.
12. Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2. PMID  11404076. S2CID  9526831.
13. Чжоу С., Хейворд С.Д. (сентябрь 2001 г.). «Ядерная локализация CBF1 регулируется взаимодействием с корепрессорным комплексом SMRT». Молекулярная и клеточная биология. 21 (18): 6222–32. Дои:10.1128 / mcb.21.18.6222-6232.2001. ЧВК  87339. PMID  11509665.
14. Куроока Х., Хондзё Т. (июнь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между внутриклеточной областью notch1 мыши и гистоновыми ацетилтрансферазами PCAF и GCN5». Журнал биологической химии. 275 (22): 17211–20. Дои:10.1074 / jbc.M000909200. PMID  10747963.
15. Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Хейворд С.Д. (февраль 2000 г.). «Роль SKIP в активации EBNA2 промоторов, репрессированных CBF1». Журнал вирусологии. 74 (4): 1939–47. Дои:10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000. ЧВК  111672. PMID  10644367.
16. Се Дж. Дж., Чжоу С., Чен Л., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (январь 1999 г.). «CIR, корепрессор, связывающий фактор связывания ДНК CBF1 с комплексом гистондеацетилазы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (1): 23–8. Bibcode:1999PNAS ... 96 ... 23H. Дои:10.1073 / pnas.96.1.23. ЧВК  15086. PMID  9874765.
17. Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, белок, связанный с CBF1, взаимодействует с доменом анкиринового повтора NotchIC, чтобы облегчить функцию NotchIC». Молекулярная и клеточная биология. 20 (7): 2400–10. Дои:10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000. ЧВК  85419. PMID  10713164.

дальнейшее чтение

• Ока С., Кавайчи М. (1995). «V (D) J-рекомбинация генов иммуноглобулинов». Достижения в биофизике. 31: 163–80. Дои:10.1016 / 0065-227X (95) 99390-B. PMID  7625272.
• Мацунами Н., Хамагучи Ю., Ямамото Ю., Кузе К., Кангава К., Мацуо Н., Кавайчи М., Хондзё Т. (1990). «Белок, связывающийся с последовательностью рекомбинации J каппа генов иммуноглобулинов, содержит последовательность, родственную мотиву интегразы». Природа. 342 (6252): 934–7. Дои:10.1038 / 342934a0. PMID  2556644. S2CID  4370462.
• Тонг X, Драпкин Р., Яламанчили Р., Мосиалос Г., Кифф Е. (сентябрь 1995 г.). «Кислый домен ядерного белка 2 вируса Эпштейна-Барра образует комплекс с новым клеточным коактиватором, который может взаимодействовать с TFIIE». Молекулярная и клеточная биология. 15 (9): 4735–44. Дои:10.1128 / mcb.15.9.4735. ЧВК  230717. PMID  7651391.
• Чжао Б., Маршалл Д. Р., Образец CE (июль 1996 г.). «Консервативный домен ядерных антигенов вируса Эпштейна-Барра 3A и 3C связывается с дискретным доменом Jkappa». Журнал вирусологии. 70 (7): 4228–36. Дои:10.1128 / JVI.70.7.4228-4236.1996. ЧВК  190353. PMID  8676443.
• Тамура К., Танигучи Ю., Миногути С., Сакаи Т., Тун Т., Фурукава Т., Хондзё Т. (декабрь 1995 г.). «Физическое взаимодействие между новым доменом рецептора Notch и фактором транскрипции RBP-J kappa / Su (H)». Текущая биология. 5 (12): 1416–23. Дои:10.1016 / S0960-9822 (95) 00279-X. HDL:2433/202204. PMID  8749394. S2CID  18442572.
• Gress TM, Müller-Pillasch F, Geng M, Zimmerhackl F, Zehetner G, Friess H, Büchler M, Adler G, Lehrach H (октябрь 1996 г.). «Профиль экспрессии, специфичный для рака поджелудочной железы». Онкоген. 13 (8): 1819–30. PMID  8895530.
• Hsieh JJ, Nofziger DE, Weinmaster G, Hayward SD (март 1997 г.). «Иммортализация вируса Эпштейна-Барра: Notch2 взаимодействует с CBF1 и блокирует дифференцировку». Журнал вирусологии. 71 (3): 1938–45. Дои:10.1128 / JVI.71.3.1938-1945.1997. ЧВК  191274. PMID  9032325.
• Астер Дж. К., Робертсон Е. С., Хассерджян Р. П., Тернер Дж. Р., Кифф Е., Скляр Дж. (Апрель 1997 г.). «Онкогенные формы NOTCH1, лишенные первичного сайта связывания для RBP-Jkappa или последовательностей ядерной локализации, сохраняют способность связываться с RBP-Jkappa и активировать транскрипцию». Журнал биологической химии. 272 (17): 11336–43. Дои:10.1074 / jbc.272.17.11336. PMID  9111040.
• Као Х.Й., Ордентлич П., Кояно-Накагава Н., Тан З., Даунс М., Кинтнер С.Р., Эванс Р.М., Кадеш Т. (август 1998 г.). «Корепрессорный комплекс гистоновой деацетилазы регулирует путь передачи сигнала Notch». Гены и развитие. 12 (15): 2269–77. Дои:10.1101 / gad.12.15.2269. ЧВК  317043. PMID  9694793.
• Се Дж. Дж., Чжоу С., Чен Л., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (январь 1999 г.). «CIR, корепрессор, связывающий фактор связывания ДНК CBF1 с комплексом гистондеацетилазы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (1): 23–8. Bibcode:1999PNAS ... 96 ... 23H. Дои:10.1073 / pnas.96.1.23. ЧВК  15086. PMID  9874765.
• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Международный журнал рака. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
• Каллахан Дж., Астер Дж., Склар Дж., Кифф Э., Робертсон Э.С. (январь 2000 г.). «Внутриклеточные формы человеческого NOTCH1 на совершенно разных уровнях взаимодействуют с RBP-jkappa в человеческих B- и T-клетках». Лейкемия. 14 (1): 84–92. Дои:10.1038 / sj.leu.2401630. PMID  10637481.
• Смит П.Р., де Хесус О., Тернер Д., Холлиоук М., Карстегл К.Э., Гриффин Б.Е., Карран Л., Ван Й., Хейворд С.Д., Фаррелл П.Дж. (апрель 2000 г.). «Структура и кодирующее содержание РНК семейства CST (BART) вируса Эпштейна-Барра». Журнал вирусологии. 74 (7): 3082–92. Дои:10.1128 / JVI.74.7.3082-3092.2000. ЧВК  111807. PMID  10708423.
• Чжоу С., Фуджимуро М., Се Дж.Дж., Чен Л., Миямото А., Вайнмастер Г., Хейворд С.Д. (апрель 2000 г.). «SKIP, CBF1-ассоциированный белок, взаимодействует с доменом анкиринового повтора NotchIC, чтобы облегчить функцию NotchIC». Молекулярная и клеточная биология. 20 (7): 2400–10. Дои:10.1128 / MCB.20.7.2400-2410.2000. ЧВК  85419. PMID  10713164.
• Куроока Х., Хондзё Т. (июнь 2000 г.). «Функциональное взаимодействие между внутриклеточной областью notch1 мыши и гистоновыми ацетилтрансферазами PCAF и GCN5». Журнал биологической химии. 275 (22): 17211–20. Дои:10.1074 / jbc.M000909200. PMID  10747963.
• Беатус П., Лундквист Дж., Оберг С., Педерсен К., Лендаль Ю. (июнь 2001 г.). «Происхождение области анкиринового повтора во внутриклеточных доменах Notch имеет решающее значение для регуляции активности промотора HES». Механизмы развития. 104 (1–2): 3–20. Дои:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID  11404076. S2CID  9526831.
• Чжоу С., Хейворд С.Д. (сентябрь 2001 г.). «Ядерная локализация CBF1 регулируется взаимодействием с корепрессорным комплексом SMRT». Молекулярная и клеточная биология. 21 (18): 6222–32. Дои:10.1128 / MCB.21.18.6222-6232.2001. ЧВК  87339. PMID  11509665.

внешние ссылки

• RBPJ + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.