Фактор транскрипции Sp2 - Sp2 transcription factor

SP2
Идентификаторы
Псевдонимы	SP2, Sp2, 4930480I16Rik, mKIAA0048, фактор транскрипции Sp2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601801 MGI: 1926162 ГомолоГен: 2340 Генные карты: SP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.32 Начните 47,896,150 бп[1] Конец 47,928,957 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 Д Начните 96,953,341 бп[2] Конец 96,982,959 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание гистондеацетилазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • иммунная реакция • транскрипция, ДНК-шаблон • рост многоклеточного организма • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6668	78912
Ансамбль	ENSG00000167182	ENSMUSG00000018678
UniProt	Q02086 Q9BRW5	Q9D2H6
RefSeq (мРНК)	NM_003110	NM_001080964 NM_030220 NM_001363225 NM_001363226
RefSeq (белок)	NP_003101	NP_001074433 NP_084496 NP_001350154 NP_001350155
Расположение (UCSC)	Chr 17: 47.9 - 47.93 Мб	Chr 11: 96.95 - 96.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции Sp2 это белок что у людей кодируется SP2 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует члена подсемейства Sp / XKLF факторов транскрипции. Белки семейства Sp представляют собой специфичные для последовательности ДНК-связывающие белки, характеризующиеся аминоконцевым доменом трансактивации и тремя карбоксиконцевыми мотивами цинковых пальцев. Этот белок содержит наименее консервативный ДНК-связывающий домен в подсемействе белков Sp, и его специфичность последовательности ДНК отличается от других белков Sp. Он локализуется в основном в субядерных фокусах, связанных с ядерным матриксом, и может активировать или в некоторых случаях подавлять экспрессию с разных промоторов.^[7]

Взаимодействия

Фактор транскрипции Sp2 может взаимодействовать с E2F1.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167182 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018678 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кингсли С., Виното А. (октябрь 1992 г.). «Клонирование GT-боксов: новое мультигенное семейство Sp1, регулирующее экспрессию гена Т-клеточного рецептора». Mol Cell Biol. 12 (10): 4251–61. Дои:10.1128 / mcb.12.10.4251. ЧВК  360348. PMID  1341900.
6. Scohy S, Van Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (октябрь 1998 г.). "Присвоение 1 генов Sp полосам хромосомы крысы 7q36 (Sp1), 10q31 → q32.1 (Sp2), 3q24 → q31 (Sp3) и 6q33 (Sp4) и гена SP2 полосам хромосомы человека 17q21.3 → q22 по in гибридизация на месте ". Cytogenet Cell Genet. 81 (3–4): 273–4. Дои:10.1159/000015044. PMID  9730617. S2CID  46786094.
7. «Ген Entrez: фактор транскрипции SP2 Sp2».
8. Rotheneder H, Geymayer S, Haidweger E (ноябрь 1999 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол. 293 (5): 1005–15. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3213. PMID  10547281.

дальнейшее чтение

• Филипсен S, Suske G (1999). «История трех пальцев: семейство факторов транскрипции Sp / XKLF млекопитающих». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (15): 2991–3000. Дои:10.1093 / nar / 27.15.2991. ЧВК  148522. PMID  10454592.
• Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Сато С., Секи Н., Каварабаяси И., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 1 (5): 223–9. Дои:10.1093 / днарес / 1.5.223. PMID  7584044.
• Ротенедер Х, Геймайер С, Хайдвегер Э (2000). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол. 293 (5): 1005–15. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3213. PMID  10547281.
• Мурфилд К.С., Фрай С.Дж., Горовиц Дж.М. (2004). «Активность связывания ДНК Sp2 и трансактивация негативно регулируются в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 279 (14): 13911–24. Дои:10.1074 / jbc.M313589200. PMID  14726517.
• Phan D, Cheng CJ, Galfione M, Vakar-Lopez F, Tunstead J, Thompson NE, Burgess RR, Najjar SM, Yu-Lee LY, Lin SH (2004). «Идентификация Sp2 в качестве репрессора транскрипции карциноэмбриональной молекулы адгезии клеток 1, связанной с антигеном, в онкогенезе». Рак Res. 64 (9): 3072–8. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-3730. PMID  15126343.
• Филлипс Р.Дж., Тайсон-Кэппер Ни Поллард А.Дж., Бейли Дж., Робсон С.К., Европа-Финнер Г.Н. (2005). «Регулирование экспрессии гена рецептора хорионического гонадотропина / лютеинизирующего гормона в миометрии человека: участие белка специфичности-1 (Sp1), Sp3, Sp4, Sp-подобных белков и гистоновых деацетилаз». J. Clin. Эндокринол. Метаб. 90 (6): 3479–90. Дои:10.1210 / jc.2004-1962. PMID  15788387.
• Ли YC, Хигаши Y, Луу C, Симидзу C, Strott CA (2005). «Элементы Sp1 в промоторе SULT2B1b и 5'-нетранслируемой области мРНК: индукция и увеличение Sp1 / Sp2 путем ингибирования гистондеацетилазы». FEBS Lett. 579 (17): 3639–45. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.05.041. PMID  15953604. S2CID  22203267.
• Симмонс С.О., Горовиц Дж.М. (2006). «Nkx3.1 связывает и отрицательно регулирует транскрипционную активность членов семейства Sp в клетках предстательной железы». Biochem. J. 393 (Pt 1): 397–409. Дои:10.1042 / BJ20051030. ЧВК  1383699. PMID  16201967.
• Мурфилд К.С., Инь Х., Николс Т.Д., Кэткарт К., Симмонс С.О., Горовиц Дж.М. (2006). «Sp2 локализуется в субядерных фокусах, связанных с ядерным матриксом». Мол. Биол. Клетка. 17 (4): 1711–22. Дои:10.1091 / mbc.E05-11-1063. ЧВК  1415311. PMID  16467376.
• Дас А., Фернандес-Запико М.Э., Цао С., Яо Дж., Фиоруччи С., Хеббель Р.П., Уррутия Р., Шах В.Х. (2007). «Нарушение репрессивного комплекса SP2 / KLF6 с помощью SHP необходимо для миграции эндотелиальных клеток, индуцированной рецептором фарнезоида X». J. Biol. Chem. 281 (51): 39105–13. Дои:10.1074 / jbc.M607720200. PMID  17071613.

внешняя ссылка

• Sp2 + транскрипция + фактор в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• FactorBook SP2