Белок, связывающий регуляторный элемент стерола 2 - Sterol regulatory element-binding protein 2

SREBF2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1UKL
Идентификаторы
Псевдонимы	SREBF2, SREBP-2, SREBP2, bHLHd2, фактор транскрипции, связывающий стериновый регуляторный элемент 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 600481 MGI: 107585 ГомолоГен: 20966 Генные карты: SREBF2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 22 (человек)
Конец	41,907,307 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	82,205,379 бп
Онтология генов
Молекулярная функция	• Активность C-8 стеролизомеразы; • Связывание ДНК; • активность димеризации белков; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • Переплет электронного ящика; • связывание с С-концом белка; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • неотъемлемый компонент мембраны; • цитозоль; • Комплекс SREBP-SCAP-Insig; • аппарат Гольджи; • мембрана эндоплазматического ретикулума; • мембрана; • Мембрана Гольджи; • эндоплазматический ретикулум; • От ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи; • цитоплазматический пузырек; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • митохондрия; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла;
Биологический процесс	• стероидный метаболический процесс; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительное регулирование доставки белка в митохондрии; • липидный обмен; • положительное регулирование хранения холестерина; • клеточный ответ на напряжение сдвига ламинарной жидкости; • клеточный ответ на голодание; • метаболический процесс холестерина; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транскрипция, ДНК-шаблон; • регуляция аутофагии митохондрии; • отрицательная регуляция оттока холестерина; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция процесса биосинтеза холестерина; • клеточный ответ на стимул липопротеинов низкой плотности;
	Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
	6721
	20788
	ENSG00000198911
	ENSMUSG00000022463
	Q12772
	Q3U1N2
	NM_004599
	NM_033218
	NP_004590
	NP_150087
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий регуляторный элемент стерола 2 (SREBP-2) также известный как фактор транскрипции 2, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBF2) - это белок что у людей кодируется SREBF2 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует повсеместно выраженный фактор транскрипции который контролирует гомеостаз холестерина путем стимуляции транскрипции регулируемых стеролом генов. Кодируемый белок содержит основную лейциновую молнию спираль-петля-спираль (bHLH-Zip ) домен.^[6]Были идентифицированы различные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) SREBF2, и обнаружено, что некоторые из них связаны с более высоким риском развития коленного сустава. остеоартроз. ^[7]

Взаимодействия

SREBF2 был показан взаимодействовать с участием INSIG1^[8]^[9] и CREB-связывающий белок.^[10]

Смотрите также

Белок, связывающий регуляторный элемент стерола

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198911 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022463 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Хуа Х, Йокояма С., Ву Дж., Бриггс М.Р., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л., Ван Х (декабрь 1993 г.). «SREBP-2, второй белок основной спирали, петли, спирали, лейциновой молнии, который стимулирует транскрипцию путем связывания с регуляторным элементом стерола». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (24): 11603–7. Bibcode:1993ПНАС ... 9011603Н. Дои:10.1073 / пнас.90.24.11603. ЧВК 48032. PMID 7903453.
^ «Ген Entrez: фактор транскрипции 2, связывающий стероловый регуляторный элемент SREBF2».
^ Цю XM, Jin CT, Wang W (апрель 2014 г.). «Связь между однонуклеотидным полиморфизмом гена белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола, и риском остеоартрита коленного сустава в китайской ханьской популяции». Журнал международных медицинских исследований. 42 (2): 320–8. Дои:10.1177/0300060513507392. PMID 24496149.
^ Добросоцкая И.Ю., Гольдштейн Дж. Л., Браун М. С., Роусон РБ (сентябрь 2003 г.). «Восстановление регулируемого стеролами транспорта эндоплазматического ретикулума в Гольджи SREBP-2 в клетках насекомых путем совместной экспрессии SCAP и Insigs млекопитающих». Журнал биологической химии. 278 (37): 35837–43. Дои:10.1074 / jbc.M306476200. PMID 12842885.
^ Ян Т., Эспеншад П.Дж., Райт М.Э., Ябе Д., Гонг И., Эберсолд Р., Гольдштейн Д.Л., Браун М.С. (август 2002 г.). «Решающий шаг в гомеостазе холестерина: стерины способствуют связыванию SCAP с INSIG-1, мембранным белком, который способствует удержанию SREBP в ER». Ячейка. 110 (4): 489–500. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00872-3. PMID 12202038. S2CID 15052132.
^ Олинер Дж. Д., Андресен Дж. М., Хансен С. К., Чжоу С., Тьян Р. (ноябрь 1996 г.). «Транскрипционная активность SREBP опосредуется посредством взаимодействия с CREB-связывающим белком». Гены и развитие. 10 (22): 2903–11. Дои:10.1101 / гад.10.22.2903. PMID 8918891.

дальнейшее чтение

Осборн TF (август 2001 г.). «Создание печени без SCAP удерживает SREBP в мембране ER и предотвращает повышенный синтез липидов в ответ на низкий уровень холестерина и высокий уровень инсулина». Гены и развитие. 15 (15): 1873–8. Дои:10.1101 / gad.916601. PMID 11485982.
Szolkiewicz M, Chmielewski M, Nogalska A, Stelmanska E, Swierczynski J, Rutkowski B (январь 2007 г.). «Потенциальная роль факторов транскрипции белков, связывающих регуляторный элемент стерола, в повреждении почек». Журнал почечного питания. 17 (1): 62–5. Дои:10.1053 / j.jrn.2006.10.009. PMID 17198935.
Хуа Х, Ву Дж., Гольдштейн Дж. Л., Браун М. С., Хоббс Х. Х. (февраль 1995 г.). «Структура человеческого гена, кодирующего белок-1, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBF1), и локализация SREBF1 и SREBF2 в хромосомах 17p11.2 и 22q13». Геномика. 25 (3): 667–73. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80009-Б. PMID 7759101.
Ёкояма С., Ван Х, Бриггс М.Р., Адмон А., Ву Дж., Хуа Х, Гольдштейн Д.Л., Браун М.С. (октябрь 1993 г.). «SREBP-1, белок основной спирали, петли, спирали, лейциновой молнии, который контролирует транскрипцию гена рецептора липопротеинов низкой плотности». Ячейка. 75 (1): 187–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (05) 80095-9. PMID 8402897. S2CID 2784016.
Ван Х, Зеленский Н.Г., Ян Дж., Сакаи Дж., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л. (март 1996 г.). «Расщепление белков, связывающих регуляторный элемент стерола (SREBP) с помощью CPP32 во время апоптоза». Журнал EMBO. 15 (5): 1012–20. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00438.x. ЧВК 449996. PMID 8605870.
Хуа Х, Сакаи Дж., Браун М.С., Голдштейн Дж. Л. (апрель 1996 г.). «Регулируемое расщепление белков, связывающих регуляторный элемент стерола, требует наличия последовательностей на обеих сторонах мембраны эндоплазматического ретикулума». Журнал биологической химии. 271 (17): 10379–84. Дои:10.1074 / jbc.271.17.10379. PMID 8626610.
Пай Дж. Т., Браун М. С., Гольдштейн Дж. Л. (май 1996 г.). «Очистка и клонирование кДНК второй цистеиновой протеазы, связанной с апоптозом, которая расщепляет и активирует белки, связывающие регуляторный элемент стерола». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (11): 5437–42. Bibcode:1996ПНАС ... 93.5437П. Дои:10.1073 / пнас.93.11.5437. ЧВК 39264. PMID 8643593.
Сато Р., Иноуэ Дж., Кавабе И., Кодама Т., Такано Т., Маэда М. (октябрь 1996 г.). "Стерол-зависимая регуляция транскрипции белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола". Журнал биологической химии. 271 (43): 26461–4. Дои:10.1074 / jbc.271.43.26461. PMID 8900111.
Олинер Дж. Д., Андресен Дж. М., Хансен С. К., Чжоу С., Тьян Р. (ноябрь 1996 г.). «Транскрипционная активность SREBP опосредуется посредством взаимодействия с CREB-связывающим белком». Гены и развитие. 10 (22): 2903–11. Дои:10.1101 / гад.10.22.2903. PMID 8918891.
Miserez AR, Cao G, Probst LC, Hobbs HH (февраль 1997 г.). «Структура человеческого гена, кодирующего белок 2, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBF2)». Геномика. 40 (1): 31–40. Дои:10.1006 / geno.1996.4525. PMID 9070916.
Дункан Э.А., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л., Сакаи Дж. (Май 1997 г.). «Сайт расщепления стерин-регулируемой протеазы, локализованный в связи leu-Ser в люменальной петле белка-2, связывающего регулирующий элемент стерол». Журнал биологической химии. 272 (19): 12778–85. Дои:10.1074 / jbc.272.19.12778. PMID 9139737.
Harris IR, Farrell AM, Holleran WM, Jackson S, Grunfeld C, Elias PM, Feingold KR (февраль 1998 г.). «Параллельная регуляция стерол-регуляторного элемента, связывающего белок-2, и ферментов синтеза холестерина и жирных кислот, но не синтеза церамидов в культивируемых кератиноцитах человека и эпидермисе мыши». Журнал липидных исследований. 39 (2): 412–22. PMID 9508001.
Кан Х.Й., Писсиос П., Чамбаз Дж., Заннис В.И. (февраль 1999 г.). «Специфичность связывания ДНК и свойства трансактивации SREBP-2, связанного с множеством сайтов на промоторе человеческого апоА-II». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (4): 1104–17. Дои:10.1093 / nar / 27.4.1104. ЧВК 148292. PMID 9927745.
Сейда Н.Г., Моула С.Дж., Хамелин Дж., Мамарбачи А.М., Бенджаннет С., Туре Б.Б., Басак А., Мунцер Дж. С., Марцинкевич Дж., Чжун М., Барале Дж. К., Лазур С., Мерфи Р. А., Кретьен М., Марцинкевич М. (февраль 1999 г.). «Изофермент субтилизина / кексина млекопитающих SKI-1: широко экспрессируемая пропротеинконвертаза с уникальной специфичностью расщепления и клеточной локализацией». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (4): 1321–6. Bibcode:1999ПНАС ... 96.1321С. Дои:10.1073 / pnas.96.4.1321. ЧВК 15461. PMID 9990022.
Нагоши Э., Имамото Н., Сато Р., Йонеда Й. (июль 1999 г.). «Ядерный импорт стеринового регуляторного элемента-связывающего белка-2, фактора транскрипции, содержащего основную спираль-петлю-спираль-лейциновую застежку-молнию (bHLH-Zip), происходит посредством прямого взаимодействия импортина бета с HLH-Zip». Молекулярная биология клетки. 10 (7): 2221–33. Дои:10.1091 / mbc.10.7.2221. ЧВК 25438. PMID 10397761.
Данхэм I, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Натура.402..489D. Дои:10.1038/990031. PMID 10591208.
ДеБоз-Бойд Р.А., Браун М.С., Ли В.П., Нохтурфт А., Гольдштейн Д.Л., Эспеншад П.Дж. (декабрь 1999 г.). «Транспортно-зависимый протеолиз SREBP: перемещение протеазы сайта 1 из Гольджи в ER устраняет необходимость в транспорте SREBP в Гольджи». Ячейка. 99 (7): 703–12. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81668-2. PMID 10619424.
Коцка Дж., Мюллер-Виланд Д., Рот Дж., Кремер Л., Мунк М., Шюрманн С., Кнебель Б., Кроне В. (январь 2000 г.). «Белки, связывающие регуляторный элемент стерола (SREBP) -1a и SREBP-2, связаны с каскадом MAP-киназ». Журнал липидных исследований. 41 (1): 99–108. PMID 10627507.
Ян Т., Гольдштейн Дж. Л., Браун М. С. (сентябрь 2000 г.). «Сверхэкспрессия мембранного домена SCAP не позволяет стеролам ингибировать выход SCAP.SREBP из эндоплазматического ретикулума». Журнал биологической химии. 275 (38): 29881–6. Дои:10.1074 / jbc.M005439200. PMID 10896675.

внешние ссылки

SREBF2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
FactorBook SREBP2

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198911 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022463 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid7903453-5] Хуа Х, Йокояма С., Ву Дж., Бриггс М.Р., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л., Ван Х (декабрь 1993 г.). «SREBP-2, второй белок основной спирали, петли, спирали, лейциновой молнии, который стимулирует транскрипцию путем связывания с регуляторным элементом стерола». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (24): 11603–7. Bibcode:1993ПНАС ... 9011603Н. Дои:10.1073 / пнас.90.24.11603. ЧВК 48032. PMID 7903453.

[entrez-6] «Ген Entrez: фактор транскрипции 2, связывающий стероловый регуляторный элемент SREBF2».

[pmid_=_24496149-7] Цю XM, Jin CT, Wang W (апрель 2014 г.). «Связь между однонуклеотидным полиморфизмом гена белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола, и риском остеоартрита коленного сустава в китайской ханьской популяции». Журнал международных медицинских исследований. 42 (2): 320–8. Дои:10.1177/0300060513507392. PMID 24496149.

[pmid12842885-8] Добросоцкая И.Ю., Гольдштейн Дж. Л., Браун М. С., Роусон РБ (сентябрь 2003 г.). «Восстановление регулируемого стеролами транспорта эндоплазматического ретикулума в Гольджи SREBP-2 в клетках насекомых путем совместной экспрессии SCAP и Insigs млекопитающих». Журнал биологической химии. 278 (37): 35837–43. Дои:10.1074 / jbc.M306476200. PMID 12842885.

[pmid12202038-9] Ян Т., Эспеншад П.Дж., Райт М.Э., Ябе Д., Гонг И., Эберсолд Р., Гольдштейн Д.Л., Браун М.С. (август 2002 г.). «Решающий шаг в гомеостазе холестерина: стерины способствуют связыванию SCAP с INSIG-1, мембранным белком, который способствует удержанию SREBP в ER». Ячейка. 110 (4): 489–500. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00872-3. PMID 12202038. S2CID 15052132.

[pmid8918891-10] Олинер Дж. Д., Андресен Дж. М., Хансен С. К., Чжоу С., Тьян Р. (ноябрь 1996 г.). «Транскрипционная активность SREBP опосредуется посредством взаимодействия с CREB-связывающим белком». Гены и развитие. 10 (22): 2903–11. Дои:10.1101 / гад.10.22.2903. PMID 8918891.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]