DMRT1 - DMRT1

DMRT1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4YJ0
Идентификаторы
Псевдонимы	DMRT1, CT154, DMT1, doublesex и родственный mab-3 фактор транскрипции 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602424 MGI: 1354733 ГомолоГен: 9280 Генные карты: DMRT1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п24.3 Начните 841,690 бп[1] Конец 969,090 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 млрд Начните 25,505,618 бп[2] Конец 25,604,329 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание хроматина • связывание ионов металлов • активность гетеродимеризации белков • GO: 0001158 Связывание проксимальной области корового промотора с последовательностью ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • активность гомодимеризации белков • идентичное связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки Биологический процесс • дифференциация клеток • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • развитие мужских гонад • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция узлового сигнального пути • Дифференцировка клеток Сертоли • положительная регуляция мейоза I • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • определение мужского пола • отрицательная регуляция мейотического деления ядра • Развитие клеток Сертоли • развитие ооцитов • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • процесс развития, связанный с воспроизводством • пролиферация мужских половых клеток • дифференциация мужского пола • клеточный морфогенез • сперматогенез • положительная регуляция митотического деления ядра • положительная регуляция развития мужских гонад • миграция зародышевых клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • половая дифференциация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1761	50796
Ансамбль	ENSG00000137090	ENSMUSG00000024837
UniProt	Q9Y5R6	Q9QZ59
RefSeq (мРНК)	NM_021951 NM_001363767	NM_015826
RefSeq (белок)	NP_068770 NP_001350696	NP_056641
Расположение (UCSC)	Chr 9: 0,84 - 0,97 Мб	Chr 19: 25.51 - 25.6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции 1, связанный с doublesex и mab-3, также известный как DMRT1, это белок который у человека кодируется DMRT1 ген.^[5][6][7]

Функция

DMRT1 - это чувствительный к дозе белок фактора транскрипции, который регулирует клетки Сертоли и половые клетки. Ген DMRT1 расположен в конце 9-й хромосомы. Этот ген находится в кластере с двумя другими членами семейства генов, имеющих общую цинковый палец -подобный ДНК-связывающий мотив (домен DM). В DM домен представляет собой древний консервативный компонент пути определения пола позвоночных, который также является ключевым регулятором развития самцов у мух и нематод и, как было установлено, является ключевым фактором, определяющим пол у кур.^[8] Большая часть белка DMRT1 находится в семенниковом канатике и клетках Сертоли, а небольшое количество - в половых клетках.

Этот ген демонстрирует специфичный для гонад и сексуально диморфный паттерн экспрессии, как и родственные двойной секс ген у плодовых мушек. Дефектное развитие яичек и XY-феминизация происходят, когда этот ген гемизиготный.^[5]Для нормального полового развития необходимы две копии гена DMRT1. Когда ген DMRT1 теряется, наиболее частым заболеванием является делеция хромосомы 9p, что вызывает аномальное образование яичек и феминизацию. Ген DMRT1 имеет решающее значение для определения мужского пола; без этого гена преобладает женская характеристика по умолчанию, а мужская характеристика незначительна или отсутствует.

Когда DMRT1 нокаутирован у мышей, у мышей обнаруживаются изменения как в клетках Сертоли, так и в половых клетках вскоре после образования гонадного гребня. Основными дефектами, связанными с нокаутом DMRT1, были остановка развития, избыточная пролиферация половых клеток и неспособность пройти мейоз, митоз или миграцию. Таким образом, модель нокаута показывает, что потеря гена DMRT1 связана с неполным развитием зародышевых клеток, что приводит к бесплодию, аномальному формированию яичек и / или феминизации пораженного человека.^{[нужна цитата ]} Было обнаружено, что индуцированный нокаут DMRT1 у взрослых мышей-самцов вызывает трансдифференцировку соматических клеток в семенниках до эквивалентных типов клеток, которые обычно обнаруживаются в яичниках.^[9] И наоборот, условная экспрессия DMRT1 в гонаде самок мышей вызвала явную трансдифференцировку соматических (гранулоза ) ячеек к эквивалентному типу ячеек (Сертоли ) обычно встречается у мужчин.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137090 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000024837 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: DMRT1 doublesex и родственный mab-3 фактор транскрипции 1».
6. Раймонд С.С., Шаму С.Е., Шен М.М., Зейферт К.Дж., Хирш Б., Ходжкин Дж., Заркавер Д. (февраль 1998 г.). «Доказательства эволюционного сохранения генов, определяющих пол». Природа. 391 (6668): 691–5. Дои:10.1038/35618. PMID  9490411. S2CID  11414843.
7. Raymond CS, Parker ED, Kettlewell JR, Brown LG, Page DC, Kusz K, Jaruzelska J, Reinberg Y, Flejter WL, Bardwell VJ, Hirsch B, Zarkower D (июнь 1999 г.). «Участок хромосомы 9p человека, необходимый для развития семенников, содержит два гена, связанных с известными половыми регуляторами». Гм. Мол. Genet. 8 (6): 989–96. Дои:10,1093 / hmg / 8.6.989. PMID  10332030.
8. Смит CA, Розлер К.Н., Онесорг Т., Камминз Д.М., Фарли П.Г., Доран Т.Дж., Синклер А.Х. (август 2009 г.). «Птичий Z-связанный ген DMRT1 необходим для определения мужского пола у цыплят». Природа. 461 (7261): 267–71. Дои:10.1038 / природа08298. PMID  19710650. S2CID  4413389.
9. Матсон К.К., Мерфи М.В., Сарвер А.Л., Гризволд, доктор медицины, Бардуэлл В.Дж., Заркавер Д. (июль 2011 г.). «DMRT1 предотвращает репрограммирование самок в послеродовых семенниках млекопитающих». Природа. 476 (7358): 101–4. Дои:10.1038 / природа10239. ЧВК  3150961. PMID  21775990.
10. Lindeman RE, Gearhart MD, Minkina A, Krentz AD, Bardwell VJ, Zarkower D (март 2015 г.). «Репрограммирование судеб половых клеток в яичнике с помощью DMRT1». Curr Biol. 25 (6): 764–71. Дои:10.1016 / j.cub.2015.01.034. ЧВК  4366330. PMID  25683803.

1. Энтони Д. Кренца, b, Марк В. Мерфиа, Шинсеог Кима, 1, Мэттью С. Кук, Бланш Капелк, Руи Жуд, Ангабин Матинд, Аарон Л. Сарвере, Кейт Л. Паркерф, Майкл Д. Гризвольд, Линдерт Х. Дж. Луидженгах, Вивиан Дж. Бардвелла и Дэвид Заркауэр. «Белок DM домена DMRT1 является дозозависимым регулятором пролиферации и плюрипотентности плодных зародышевых клеток». Белок домена DM DMRT1 является дозозависимым регулятором пролиферации и плюрипотентности зародышевых клеток плода. PNAS, 29 октября 2009 г. Web. 12 марта 2014 г.
2. Кристофер С. Раймонд1, Эмили Д. Паркер2, Джей Р. Кеттлвелл1, Лаура Г. Браун3, Дэвид К. Пейдж3, Камила Куш4, Ядвига Ярузельска4, Юрий Рейнберг5, Венди Л. Флейтер6, Вивиан Дж. Бардвелл1,2, Бетси Хирш7 и Дэвид Zarkower1. «Молекулярная генетика человека». Область хромосомы 9p человека, необходимая для развития семенников, содержит два гена, относящиеся к известным сексуальным регуляторам. Oxford Journal, без даты. Интернет. 28 февраля 2014 г.
3. Крейг А. Смит, Келли Н. Рёсслер, Томас Онесорг, Дэвид М. Камминс, Питер Г. Фарли, Тимоти Дж. Доран и Эндрю Х. Синклер. «Птичий Z-связанный ген DMRT1 необходим для определения мужского пола у цыплят». Nature.com. Nature, 26 августа 2009 г. Web. 12 марта 2014 г.
4. «Ген DMRT1». - Генные карты. Центр генома человека Crown, Отдел молекулярной генетики, Научный институт Вейцмана,http://genome.ucsc.edu/. 23 октября 2013 г. Web. 12 марта 2014 г.
5. Нинг Лей, Каори И. Хорнбейкер, Дарен А. Райс, Татьяна Карпова, Валентин А. Агбор и Лесли Л. Хекерт. «Половые различия в экспрессии DMRT1 у мышей зависят как от типа клеток, так и от стадии развития гонад». Половые различия в экспрессии DMRT1 у мышей зависят как от типа клеток, так и от стадии развития гонад. NIH Public Access, 13 июня 2007 г. Интернет. 12 марта 2014 г.

дальнейшее чтение

• Smith CA, McClive PJ, Western PS и др. (2000). «Сохранение гена, определяющего пол». Природа. 402 (6762): 601–2. Дои:10.1038/45127. PMID  10604464. S2CID  4401771.
• Кальвари В., Бертини В., Де Гранди А. и др. (2000). «Новая субмикроскопическая делеция, которая уточняет область 9p для смены пола». Геномика. 65 (3): 203–12. Дои:10.1006 / geno.2000.6160. PMID  10857744.
• Муроя К., Окуяма Т., Гоиси К. и др. (2000). «Ген (ы), определяющий пол на дистальном участке 9р: клинические и молекулярные исследования в шести случаях». J. Clin. Эндокринол. Метаб. 85 (9): 3094–100. Дои:10.1210 / jc.85.9.3094. PMID  10999792.
• Раймонд С.С., Мерфи М.В., О'Салливан М.Г. и др. (2000). «Dmrt1, ген, связанный с половыми регуляторами червей и мух, необходим для дифференциации семенников млекопитающих». Genes Dev. 14 (20): 2587–95. Дои:10.1101 / gad.834100. ЧВК  316999. PMID  11040213.
• Каши Т. (2001). "Это мужское дело". Nat. Преподобный Жене. 1 (3): 169. Дои:10.1038/35042034. PMID  11252745. S2CID  205010812.
• Харрингтон Дж. Дж., Шерф Б., Рандлетт С. и др. (2001). «Создание полногеномных библиотек экспрессии белков с использованием случайной активации экспрессии генов». Nat. Биотехнология. 19 (5): 440–5. Дои:10.1038/88107. PMID  11329013. S2CID  25064683.
• Бойер А., Дорнан С., Дано И. и др. (2004). «Сохранение функции регуляторных последовательностей DMRT1 в дифференцировке пола млекопитающих». Бытие. 34 (4): 236–43. Дои:10.1002 / ген.10158. PMID  12434333. S2CID  7891350.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Cheng HH, Ying M, Tian YH и др. (2006). «Транскрипционное разнообразие DMRT1 (родственный dsx- и mab3 транскрипционный фактор 1) в яичках человека». Cell Res. 16 (4): 389–93. Дои:10.1038 / sj.cr.7310050. PMID  16617334.
• * 1. Участок хромосомы 9p человека, необходимый для развития семенников, содержит два гена, связанных с известными половыми регуляторами. (PubMed id 10332030) 1, 2, 3, 9 Раймонд К.С. .... Заркауэр Д. (1999)
• 2. Доказательства эволюционного сохранения генов, определяющих пол. (PubMed id 9490411) 1, 2, 3, 9 Раймонд К.С. .... Зарковер Д. (1998)
• 3. Варианты, близкие к DMRT1, TERT и ATF7IP, связаны с раком зародышевых клеток яичка. (PubMed id 20543847) 1, 2, 4 Тернбулл К. ... Рахман Н. (2010)
• 4. Транскрипционное разнообразие DMRT1 (родственный dsx- и mab3 транскрипционный фактор 1) в семенниках человека. (PubMed id 16617334) 1, 2, 9 Cheng H.H .... Zhou R.J. (2006)
• 5. Новая субмикроскопическая делеция, которая уточняет область 9p для смены пола. (PubMed id 10857744) 1, 2, 9 Кальвари В. .... Гуйоли С. (2000)
• 6. Второй независимый локус в DMRT1 связан с восприимчивостью к опухоли зародышевых клеток яичка. (PubMed id 21551455) 1, 4 Канецкий П.А. .... Натансон К.Л. (2011)
• 7. Персонализированный отказ от курения: взаимосвязь между дозой никотина, зависимостью и оценкой генотипа успеха в отказе от курения. (PubMed id 20379614) 1, 4 Rose J.E .... Uhl G.R. (2010)
• 8. Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 9. (PubMed id 15164053) 1, 2 Хамфрей С.Дж ... Данхэм И. (2004)
• 9. Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC). (PubMed id 15489334) 1,2 Герхард Д.С. .... Малек Дж. (2004)
• 10. Белок домена DM DMRT1 является дозозависимым регулятором пролиферации и плюрипотентности зародышевых клеток плода. (PubMed id 20007774) 1, 9 Krentz A.D .... Zarkower D. (2009)

внешняя ссылка

• DMRT1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• https://web.archive.org/web/20110720091853/http://www.dmrt1.umn.edu/
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9Y5R6 (Фактор транскрипции 1, связанный с Doublesex- и mab-3) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.