KMT2D - KMT2D - Wikipedia

KMT2D
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыKMT2D, ALR, KABUK1, MLL2, MLL4, лизинметилтрансфераза 2D, гистон-лизинметилтрансфераза 2D, TNRC21, AAD10, KMS, CAGL114
Внешние идентификаторыOMIM: 602113 MGI: 2682319 ГомолоГен: 86893 Генные карты: KMT2D
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение KMT2D
Геномное расположение KMT2D
Группа12q13.12Начинать49,018,975 бп[1]
Конец49,059,774 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE MLL2 211790 s в формате fs.png

PBB GE MLL2 216845 x at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

8085

381022

Ансамбль

ENSG00000167548

ENSMUSG00000048154

UniProt

O14686

Q6PDK2

RefSeq (мРНК)

NM_003482

NM_001033276
NM_001033388

RefSeq (белок)

NP_003473

NP_001028448

Расположение (UCSC)Chr 12: 49.02 - 49.06 МбChr 15: 98,83 - 98,87 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гистон-лизин-N-метилтрансфераза 2D (KMT2D), также известный как MLL4 и иногда MLL2 у людей и Mll4 у мышей является основным млекопитающим гистон H3 лизин 4 (H3K4) моно-метилтрансфераза.[5] Он является частью семейства из шести Set1-подобных метилтрансфераз H3K4, которые также содержат KMT2A (или MLL1), KMT2B (или MLL2), KMT2C (или MLL3), KMT2F (или SET1A), и KMT2G (или SET1B).

KMT2D - это большой белок более 5 500 аминокислоты по размеру и широко выражен во взрослых тканях.[6] Белок совмещен с определением происхождения факторы транскрипции на энхансеры транскрипции и важен для дифференциация клеток и эмбриональное развитие.[5] Он также играет важную роль в регулировании судьба клетки переход,[5][7][8][9] метаболизм,[10][11] и подавление опухоли.[12][13][14][15]

Мутации в KMT2D были связаны с Синдром Кабуки,[16] врожденный порок сердца,[17] и различные формы рака.[18]

Структура

Ген

У мышей KMT2D кодируется Kmt2d ген, расположенный на хромосоме 15F1. Его транскрипт имеет длину 19823 пары оснований и содержит 55 экзонов и 54 интрона.[19] У людей KMT2D кодируется KMT2D ген, расположенный на хромосоме 12q13.12. Его транскрипт имеет длину 19 419 пар оснований и содержит 54 экзона и 53 интрона.[20]

Протеин

KMT2D гомологичен Trithorax-related (Trr), который является Белок группы триторакс.[21] Белки KMT2D мыши и человека имеют длину 5 588 и 5 537 аминокислот соответственно. Оба вида белка весят около 600 кДа.[19][20] KMT2D содержит ферментативно активный C-концевой домен SET, который отвечает за его активность метилтрансферазы и поддерживает стабильность белка в клетках.[22] Рядом с доменом SET находятся гомеотический домен растения (PHD) и FY-богатые N / C-концевые (FYRN и FYRC) домены. Белок также содержит шесть N-концевых PHD, группу с высокой подвижностью (HMG-I) и девять мотивов, взаимодействующих с ядерным рецептором (LXXLL).[18] Было показано, что аминокислоты Y5426 и Y5512 имеют решающее значение для ферментативной активности KMT2D человека. in vitro.[23] Кроме того, мутация Y5477 в KMT2D мыши, которая соответствует Y5426 в KMT2D человека, привела к инактивации ферментативной активности KMT2D в эмбриональных стволовых клетках.[24] Истощение клеточного метилирования H3K4 снижает уровни KMT2D, указывая на то, что стабильность белка может регулироваться клеточным метилированием H3K4.[23]

Белковый комплекс

Некоторые компоненты комплекса KMT2D были впервые очищены в 2003 г.[25] а затем в 2007 году был опознан весь комплекс.[26][27][28][29] Наряду с KMT2D комплекс также содержит ASH2L, RbBP5, WDR5, DPY30, NCOA6, UTX (также известный как KDM6A), PA1 и PTIP. WDR5, RbBP5, ASH2L и DPY30 образуют четырехсубъединичный субкомплекс WRAD, который является критическим для активности метилтрансферазы H3K4 во всех Set1-подобных комплексах гистон-метилтрансфераз млекопитающих.[30] WDR5 непосредственно связывается с доменами FYRN / FYRC содержащих С-концевой домен SET фрагментов человеческих KMT2C и KMT2D.[26] UTX, комплексная деметилаза H3K27, PTIP и PA1 являются субъединицами, уникальными для KMT2C и KMT2D.[26][31][32] KMT2D действует как скаффолдный белок в комплексе; отсутствие KMT2D приводит к дестабилизации UTX и коллапсу комплекса в клетках.[5][23]

Регулирование усилителя

KMT2D является основным энхансером моно-метилтрансферазы и имеет частичную функциональную избыточность с KMT2C.[5][7] Белок избирательно связывает энхансерные области в зависимости от типа клетки и стадии дифференцировки. Во время дифференцировки определяющие клон факторы транскрипции рекрутируют KMT2D для создания энхансеров, специфичных для клеточного типа. Например, CCAAT / связывающий энхансер белок β (C / EBPβ), фактор ранней адипогенной транскрипции, рекрутирует и требует, чтобы KMT2D установил субнабор адипогенных энхансеров во время адипогенеза. Истощение KMT2D перед дифференцировкой предотвращает накопление моно-метилирования H3K4 (H3K4me1 ), Ацетилирование H3K27, медиатор коактиватора транскрипции и РНК-полимераза II на энхансерах, что приводит к серьезным дефектам экспрессии генов и дифференцировке клеток.[5] KMT2C и KMT2D также определяют суперэнхансеры и необходимы для образования суперэнхансеров во время дифференцировки клеток.[33] Механически KMT2C и KMT2D необходимы для связывания CREB-связывающего белка (CBP) ацетилтрансферазы H3K27 и / или p300 на энхансерах, активации энхансера и зацикливания энхансера-промотора до транскрипции гена.[5][33] Белки KMT2C и KMT2D, а не KMT2C и KMT2D-опосредованный H3K4me1, контролируют рекрутирование p300 в энхансеры, активацию энхансера и транскрипцию с промоторов в эмбриональных стволовых клетках.[7]

Функции

Разработка

Нокаут всего тела Kmt2d у мышей приводит к ранней эмбриональной гибели.[5] Целенаправленное выбивание Kmt2d в клетках-предшественниках коричневых адипоцитов и миоцитов приводит к уменьшению коричневой жировой ткани и мышечной массы у мышей, указывая на то, что KMT2D необходим для развития жировой и мышечной ткани.[5] В сердцах мышей единственная копия Kmt2d гена достаточно для нормального развития сердца.[34] Полная потеря Kmt2d в сердечных предшественниках и миокарде приводит к тяжелым сердечным дефектам и ранней эмбриональной летальности. KMT2D-опосредованное моно- и диметилирование необходимо для поддержания необходимых программ экспрессии генов во время развития сердца. Нокаут-исследования на мышах также показывают, что KMT2D необходим для правильного развития B-клеток.[12]

Переход клеточной судьбы

KMT2D частично функционально дублирует KMT2C и необходим для дифференцировки клеток в культуре.[5][7] KMT2D регулирует индукцию адипогенных и миогенных генов и необходим для экспрессии генов, специфичных для клеточного типа, во время дифференцировки. KMT2C и KMT2D необходимы для адипогенеза и миогенеза.[5] Сходные функции наблюдаются при дифференцировке нейронов и остеобластов.[8][9] KMT2D облегчает переход клеточной судьбы за счет прайминга энхансеров (через H3K4me1) для активации, опосредованной p300. Чтобы p300 связывался с энхансером, необходимо физическое присутствие KMT2D, а не только KMT2D-опосредованного H3K4me1. Однако KMT2D незаменим для поддержания идентичности эмбриональных стволовых клеток и соматических клеток.[7]

Метаболизм

KMT2D частично функционально дублирует KMT2C в печени. Гетерозиготный Kmt2d+/- мыши демонстрируют повышенную толерантность к глюкозе и чувствительность к инсулину, а также повышенное содержание желчной кислоты в сыворотке крови.[10] KMT2C и KMT2D являются важными эпигенетическими регуляторами циркадных часов печени и коактиваторами орфанных рецепторов (ROR), связанных с ретиноидными факторами циркадной транскрипции -α и -γ.[10] У мышей KMT2D также действует как коактиватор PPARγ в печени, направляя стеатоз, вызванный избыточным питанием. Гетерозиготный Kmt2d+/- мыши проявляют устойчивость к стеатозу печени, вызванному избыточным питанием.[11]

Подавление опухоли

KMT2C и KMT2D вместе с NCOA6 действуют как коактиваторы p53, хорошо зарекомендовавшего себя супрессора опухолей и фактора транскрипции, и необходимы для эндогенной экспрессии p53 в ответ на доксорубицин, агент, повреждающий ДНК.[13] KMT2C и KMT2D также участвуют в супрессорных функциях опухолей при остром миелоидном лейкозе, фолликулярной лимфоме и диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме.[12][14][15] Нокаут Kmt2d у мышей отрицательно влияет на экспрессию генов-супрессоров опухолей TNFAIP3, SOCS3, и TNFRSF14.[15]

И наоборот, дефицит KMT2D в нескольких линиях клеток рака молочной железы и толстой кишки приводит к снижению пролиферации.[35][36][37] Было показано, что увеличение KMT2D способствует открытию хроматина и привлечению факторов транскрипции, включая рецептор эстрогена (ER), в ER-положительных клетках рака молочной железы.[38] Таким образом, KMT2D может иметь различные эффекты на подавление опухоли в разных типах клеток.

Клиническое значение

Мутации потери функции в KMT2D, также известные как MLL2 у людей, были идентифицированы при синдроме Кабуки,[16] с частотой встречаемости мутаций от 56% до 75%.[39][40][41] Врожденный порок сердца связан с избытком мутаций в генах, которые регулируют метилирование H3K4, включая KMT2D.[17]

Мутации со сдвигом рамки считывания и нонсенс-мутации в доменах SET и PHD затрагивают 37% и 60%, соответственно, от общего числа KMT2D мутации при раке.[18] Раки с соматическими мутациями в KMT2D чаще всего возникают в головном мозге, лимфатических узлах, крови, легких, толстом кишечнике и эндометрии.[18] Эти виды рака включают медуллобластому,[42][43][44] феохромоцитома,[45] неходжкинские лимфомы,[46] кожная Т-клеточная лимфома, синдром Сезари,[47] карциномы мочевого пузыря, легких и эндометрия,[48] плоскоклеточный рак пищевода,[49][50][51] панкреатический рак,[52] и рак простаты.[53]

Примечания

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167548 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048154 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c d е ж грамм час я j k Ли Дж.Э., Ван Ц., Сюй С., Чо Ю.В., Ван Л., Фэн Х и др. (Декабрь 2013). «Моно- и диметилтрансфераза H3K4 MLL4 необходима для активации энхансера во время дифференцировки клеток». eLife. 2: e01503. Дои:10.7554 / eLife.01503. ЧВК  3869375. PMID  24368734.
  6. ^ Прасад Р., Жаданов А.Б., Седков Ю., Буллрих Ф., Драк Т., Раллапалли Р. и др. (Июль 1997 г.). «Структура и паттерн экспрессии человеческого ALR, нового гена с сильной гомологией с ALL-1, вызывающим острый лейкоз, и с Drosophila trithorax». Онкоген. 15 (5): 549–60. Дои:10.1038 / sj.onc.1201211. PMID  9247308.
  7. ^ а б c d е Ван С., Ли Дж. Э., Лай Б., Макфарлан Т. С., Сюй С., Чжуан Л., Лю С., Пэн В., Ге К. (октябрь 2016 г.). «Энхансер-праймирование с помощью H3K4-метилтрансферазы MLL4 контролирует переход клеточной судьбы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (42): 11871–11876. Дои:10.1073 / pnas.1606857113. ЧВК  5081576. PMID  27698142.
  8. ^ а б Дхар С.С., Ли С.Х., Кан П.Й., Фойгт П., Ма Л., Ши Икс, Рейнберг Д., Ли М.Г. (декабрь 2012 г.). «Транс-хвостовая регуляция метилирования H3K4, катализируемого MLL4, посредством симметричного диметилирования H4R3 опосредуется тандемным PHD MLL4». Гены и развитие. 26 (24): 2749–62. Дои:10.1101 / gad.203356.112. ЧВК  3533079. PMID  23249737.
  9. ^ а б Мунехира Й., Ян З., Гозани О. (октябрь 2016 г.). «Систематический анализ известных и потенциальных лизин-деметилаз в регуляции дифференцировки миобластов». Журнал молекулярной биологии. 429 (13): 2055–2065. Дои:10.1016 / j.jmb.2016.10.004. ЧВК  5388604. PMID  27732873.
  10. ^ а б c Kim DH, Rhee JC, Yeo S, Shen R, Lee SK, Lee JW, Lee S (март 2015 г.). «Решающая роль лейкемии смешанного происхождения 3 и 4 как эпигенетических переключателей циркадных часов печени, контролирующих гомеостаз желчных кислот у мышей». Гепатология. 61 (3): 1012–23. Дои:10.1002 / hep.27578. ЧВК  4474368. PMID  25346535.
  11. ^ а б Ким Д.Х., Ким Дж., Квон Дж. С., Сандху Дж., Тонтоноз П., Ли С. К., Ли С., Ли Дж. У. (ноябрь 2016 г.). «Критические роли гистон-метилтрансферазы MLL4 / KMT2D в стеатозе печени мышей, направляемом ABL1 и PPARγ2». Отчеты по ячейкам. 17 (6): 1671–1682. Дои:10.1016 / j.celrep.2016.10.023. PMID  27806304.
  12. ^ а б c Чжан Дж., Домингес-Сола Д., Хусейн С., Ли Дж. Э., Холмс А. Б., Бансал М. и др. (Октябрь 2015 г.). «Нарушение KMT2D нарушает развитие В-клеток зародышевого центра и способствует лимфомагенезу». Природа Медицина. 21 (10): 1190–8. Дои:10,1038 / 3940 нм. ЧВК  5145002. PMID  26366712.
  13. ^ а б Ли Дж., Ким Д.Х., Ли С., Ян К.Х., Ли Д.К., Ли С.К., Рёдер Р.Г., Ли Дж.В. (май 2009 г.). «Коактиваторный комплекс p53, содержащий ASC-2 и гистон H3-лизин-4-метилтрансферазу MLL3 или его паралог MLL4». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (21): 8513–8. Дои:10.1073 / pnas.0902873106. ЧВК  2689008. PMID  19433796.
  14. ^ а б Chen C, Liu Y, Rappaport AR, Kitzing T, Schultz N, Zhao Z, Shroff AS, Dickins RA, Vakoc CR, Bradner JE, Stock W, LeBeau MM, Shannon KM, Kogan S, Zuber J, Lowe SW (май 2014 г.) ). «MLL3 является гаплонедостаточным опухолевым супрессором 7q при остром миелоидном лейкозе». Раковая клетка. 25 (5): 652–65. Дои:10.1016 / j.ccr.2014.03.016. ЧВК  4206212. PMID  24794707.
  15. ^ а б c Ортега-Молина А., Босс И. В., Канела А., Пан Х., Цзян Ю., Чжао С. и др. (Октябрь 2015 г.). «Гистон-лизинметилтрансфераза KMT2D поддерживает программу экспрессии генов, которая подавляет развитие В-клеточной лимфомы». Природа Медицина. 21 (10): 1199–208. Дои:10,1038 / 3943 нм. ЧВК  4676270. PMID  26366710.
  16. ^ а б Ng SB, Bigham AW, Buckingham KJ, Hannibal MC, McMillin MJ, Gildersleeve HI, et al. (Сентябрь 2010 г.). «Секвенирование экзома определяет мутации MLL2 как причину синдрома Кабуки». Природа Генетика. 42 (9): 790–3. Дои:10,1038 / нг.646. ЧВК  2930028. PMID  20711175.
  17. ^ а б Заиди С., Чой М., Вакимото Х., Ма Л., Цзян Дж., Овертон Дж. Д. и др. (Июнь 2013). «Мутации de novo в генах, модифицирующих гистоны, при врожденных пороках сердца» (PDF). Природа. 498 (7453): 220–3. Дои:10.1038 / природа12141. ЧВК  3706629. PMID  23665959.
  18. ^ а б c d Рао Р.С., Доу И (июнь 2015 г.). «Захвачено при раке: семейство метилтрансфераз KMT2 (MLL)». Обзоры природы. Рак. 15 (6): 334–46. Дои:10.1038 / nrc3929. ЧВК  4493861. PMID  25998713.
  19. ^ а б «Расшифровка: Kmt2d-001 (ENSMUST00000023741.15) - Резюме - Mus musculus - Браузер генома ансамбля 88». www.ensembl.org.
  20. ^ а б «Расшифровка: KMT2D-001 (ENST00000301067.11) - Резюме - Homo sapiens - Обозреватель генома ансамбля 88». www.ensembl.org.
  21. ^ Mohan M, Herz HM, Smith ER, Zhang Y, Jackson J, Washburn MP, Florens L, Eissenberg JC, Shilatifard A (ноябрь 2011 г.). «Семейство COMPASS метилаз H3K4 у дрозофилы». Молекулярная и клеточная биология. 31 (21): 4310–8. Дои:10.1128 / MCB.06092-11. ЧВК  3209330. PMID  21875999.
  22. ^ Рутенбург AJ, Allis CD, Wysocka J (январь 2007 г.). «Метилирование лизина 4 на гистоне H3: сложность записи и чтения одной эпигенетической метки». Молекулярная клетка. 25 (1): 15–30. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.12.014. PMID  17218268.
  23. ^ а б c Чан И, Ван Ц., Чжуан Л., Лю Ц., Ге К. (декабрь 2016 г.). «Активность метилтрансферазы H3K4 необходима для стабильности белка MLL4». Журнал молекулярной биологии. 429 (13): 2046–2054. Дои:10.1016 / j.jmb.2016.12.016. ЧВК  5474351. PMID  28013028.
  24. ^ Дориги К.М., Свигут Т., Энрикес Т., Бхану Н.В., Скраггс Б.С., Нади Н., Стилл К.Д., Гарсия Б.А., Адельман К., Высоцка Дж. (Май 2017 г.). «Mll3 и Mll4 способствуют синтезу и транскрипции энхансерной РНК с промоторов независимо от монометилирования H3K4». Молекулярная клетка. 66 (4): 568–576.e4. Дои:10.1016 / j.molcel.2017.04.018. ЧВК  5662137. PMID  28483418.
  25. ^ Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC , Ли JW (январь 2003 г.). «Коинтегратор сигнала активации 2 принадлежит к новому стационарному комплексу, который содержит субнабор белков группы триторакса». Молекулярная и клеточная биология. 23 (1): 140–9. Дои:10.1128 / mcb.23.1.140-149.2003. ЧВК  140670. PMID  12482968.
  26. ^ а б c Cho YW, Hong T, Hong S, Guo H, Yu H, Kim D, Guszczynski T, Dressler GR, Copeland TD, Kalkum M, Ge K (июль 2007 г.). «PTIP связывается с MLL3- и MLL4-содержащим гистон H3 лизин-4-метилтрансферазным комплексом». Журнал биологической химии. 282 (28): 20395–406. Дои:10.1074 / jbc.M701574200. ЧВК  2729684. PMID  17500065.
  27. ^ Исаева И., Зонис Ю., Розовская Т., Орловский К., Кроче С.М., Накамура Т., Мазо А., Айзенбах Л., Канаани Е. (март 2007 г.). «Нокдаун ALR (MLL2) выявляет гены-мишени ALR и приводит к изменениям в адгезии и росте клеток». Молекулярная и клеточная биология. 27 (5): 1889–903. Дои:10.1128 / MCB.01506-06. ЧВК  1820476. PMID  17178841.
  28. ^ Ли М.Г., Вилла Р., Тройер П., Норман Дж., Ян К.П., Рейнберг Д., Ди Кроче Л., Шихаттар Р. (октябрь 2007 г.). «Деметилирование H3K27 регулирует рекрутирование поликомб и убиквитинирование H2A». Наука. 318 (5849): 447–50. Дои:10.1126 / science.1149042. PMID  17761849. S2CID  23883131.
  29. ^ Патель А., Воут В. Е., Дхармараджан В., Косгроув М. С. (ноябрь 2008 г.). «Консервативный аргининсодержащий мотив, критически важный для сборки и ферментативной активности ядерного комплекса белок-1 смешанного клона лейкемии». Журнал биологической химии. 283 (47): 32162–75. Дои:10.1074 / jbc.M806317200. PMID  18829457.
  30. ^ Эрнст П., Вакок ЧР (май 2012 г.). «WRAD: активатор SET1-семейства метилтрансфераз H3K4». Брифинги по функциональной геномике. 11 (3): 217–26. Дои:10.1093 / bfgp / els017. ЧВК  3388306. PMID  22652693.
  31. ^ Чо Ю.В., Хонг С., Ге К. (2012). «Аффинность очистки комплекса метилтрансферазы гистона H3K4 MLL3 / MLL4». Аффинная очистка комплекса метилтрансферазы гистона H3K4 MLL3 / MLL4. Методы молекулярной биологии. 809. С. 465–72. Дои:10.1007/978-1-61779-376-9_30. ISBN  978-1-61779-375-2. ЧВК  3467094. PMID  22113294.
  32. ^ Hong S, Cho YW, Yu LR, Yu H, Veenstra TD, Ge K (ноябрь 2007 г.). «Идентификация UTX и JMJD3, содержащих домен JmjC, как деметилазы лизина 27 гистона H3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (47): 18439–44. Дои:10.1073 / pnas.0707292104. ЧВК  2141795. PMID  18003914.
  33. ^ а б Лай Би, Ли Дж. Э., Чан И, Ван Л., Пэн В., Ге К. (апрель 2017 г.). «MLL3 / MLL4 необходимы для связывания CBP / p300 с энхансерами и образования супер-энхансера в коричневом адипогенезе». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (11): 6388–6403. Дои:10.1093 / нар / gkx234. ЧВК  5499743. PMID  28398509.
  34. ^ Ang SY, Uebersohn A, Spencer CI, Huang Y, Lee JE, Ge K, Bruneau BG (март 2016 г.). «KMT2D регулирует определенные программы в развитии сердца посредством диметилирования лизина 4 гистона H3». Разработка. 143 (5): 810–21. Дои:10.1242 / dev.132688. ЧВК  4813342. PMID  26932671.
  35. ^ Guo C, Chen LH, Huang Y, Chang CC, Wang P, Pirozzi CJ и др. (Ноябрь 2013). «KMT2D поддерживает пролиферацию неопластических клеток и глобальное монометилирование лизина 4 гистона H3». Oncotarget. 4 (11): 2144–53. Дои:10.18632 / oncotarget.1555. ЧВК  3875776. PMID  24240169.
  36. ^ Ким Дж. Х., Шарма А., Дхар СС, Ли Ш., Гу Би, Чан СН, Линь Х. К., Ли М. Г. (март 2014 г.). «UTX и MLL4 координируют программы транскрипции для пролиферации и инвазивности клеток рака груди». Исследования рака. 74 (6): 1705–17. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-13-1896. ЧВК  3962500. PMID  24491801.
  37. ^ Мо Р, Рао С.М., Чжу Ю.Дж. (июнь 2006 г.). «Идентификация комплекса MLL2 как коактиватора рецептора эстрогена альфа». Журнал биологической химии. 281 (23): 15714–20. Дои:10.1074 / jbc.M513245200. PMID  16603732.
  38. ^ Тоска Э, Османбейоглу Х.Ю., Кастель П., Чан С., Хендриксон Р.С., Элкабец М., Диклер М.Н., Скалтрити М., Лесли К.С., Армстронг С.А., Базельга Дж. (Март 2017 г.). «Путь PI3K регулирует ER-зависимую транскрипцию при раке груди через эпигенетический регулятор KMT2D». Наука. 355 (6331): 1324–1330. Дои:10.1126 / science.aah6893. ЧВК  5485411. PMID  28336670.
  39. ^ Bögershausen N, Wollnik B (март 2013 г.). «Разоблачение синдрома Кабуки». Клиническая генетика. 83 (3): 201–11. Дои:10.1111 / cge.12051. PMID  23131014. S2CID  204999137.
  40. ^ Ли Й., Бегерсхаузен Н., Аланай Й., Симсек Кипер П.О., Плюм Н., Кеупп К. и др. (Декабрь 2011 г.). «Скрининг мутаций у пациентов с синдромом Кабуки». Генетика человека. 130 (6): 715–24. Дои:10.1007 / s00439-011-1004-y. PMID  21607748. S2CID  12327505.
  41. ^ Paulussen AD, Stegmann AP, Blok MJ, Tserpelis D, Posma-Velter C, Detisch Y, et al. (Февраль 2011 г.). «Спектр мутаций MLL2 у 45 пациентов с синдромом Кабуки» (PDF). Человеческая мутация. 32 (2): E2018–25. Дои:10.1002 / humu.21416. PMID  21280141. S2CID  7380692.
  42. ^ Пью Т.Дж., Вираратне С.Д., Арчер Т.К., Померанц Краммель Д.А., Оклер Д., Бочиччио Дж. И др. (Август 2012 г.). «Секвенирование экзома медуллобластомы выявляет соматические мутации, специфичные для подтипа». Природа. 488 (7409): 106–10. Дои:10.1038 / природа11329. ЧВК  3413789. PMID  22820256.
  43. ^ Парсонс Д.В., Ли М., Чжан Х, Джонс С., Лири Р.Дж., Лин Дж.С. и др. (Январь 2011 г.). «Генетический ландшафт медуллобластомы рака у детей». Наука. 331 (6016): 435–9. Дои:10.1126 / science.1198056. ЧВК  3110744. PMID  21163964.
  44. ^ Джонс Д. Т., Джегер Н., Кул М., Зихнер Т., Хаттер Б., Султан М. и др. (Август 2012 г.). «Рассмотрение геномной сложности, лежащей в основе медуллобластомы». Природа. 488 (7409): 100–5. Дои:10.1038 / природа11284. ЧВК  3662966. PMID  22832583.
  45. ^ Джухлин С.С., Стенман А., Хаглунд Ф., Кларк В.Э., Браун Т.С., Бараноски Дж. И др. (Сентябрь 2015 г.). «Секвенирование всего экзома определяет мутационный ландшафт феохромоцитомы и идентифицирует KMT2D как рекуррентно мутировавший ген». Гены, хромосомы и рак. 54 (9): 542–54. Дои:10.1002 / gcc.22267. ЧВК  4755142. PMID  26032282.
  46. ^ Морин Р.Д., Мендес-Лаго М., Мунгалл А.Дж., Гойя Р., Мунгалл К.Л., Корбетт Р.Д. и др. (Июль 2011 г.). «Частая мутация генов, модифицирующих гистоны, при неходжкинской лимфоме». Природа. 476 (7360): 298–303. Дои:10.1038 / природа10351. ЧВК  3210554. PMID  21796119.
  47. ^ да Силва Алмейда А.С., Абате Ф., Хиабанян Х., Мартинес-Эскала Э., Гитарт Дж., Тенсен С.П., Вермеер М.Х., Рабадан Р., Феррандо А., Паломеро Т. (декабрь 2015 г.). «Мутационный ландшафт кожной Т-клеточной лимфомы и синдрома Сезари». Природа Генетика. 47 (12): 1465–70. Дои:10,1038 / нг.3442. ЧВК  4878831. PMID  26551667.
  48. ^ Кандот С., Маклеллан, доктор медицины, Вандин Ф, Е К., Ниу Б., Лу С. и др. (Октябрь 2013). «Мутационный ландшафт и значение 12 основных типов рака». Природа. 502 (7471): 333–9. Дои:10.1038 / природа12634. ЧВК  3927368. PMID  24132290.
  49. ^ Гао YB, Chen ZL, Li JG, Hu XD, Shi XJ, Sun ZM и др. (Октябрь 2014 г.). «Генетический ландшафт плоскоклеточного рака пищевода». Природа Генетика. 46 (10): 1097–102. Дои:10.1038 / ng.3076. PMID  25151357. S2CID  32172173.
  50. ^ Линь Д.К., Хао Дж.Дж., Нагата Ю., Сюй Л., Шан Л., Мэн Х, Сато Й, Окуно Ю., Варела А.М., Дин Л.В., Гарг М., Лю Л.З., Ян Х., Инь Д, Ши З.З., Цзян Ю.Й., Гу ВЙ , Gong T, Zhang Y, Xu X, Kalid O, Shacham S, Ogawa S, Wang MR, Koeffler HP (май 2014 г.). «Геномная и молекулярная характеристика плоскоклеточного рака пищевода». Природа Генетика. 46 (5): 467–73. Дои:10,1038 / нг.2935. ЧВК  4070589. PMID  24686850.
  51. ^ Song Y, Li L, Ou Y, Gao Z, Li E, Li X и др. (Май 2014 г.). «Идентификация геномных изменений при плоскоклеточном раке пищевода». Природа. 509 (7498): 91–5. Дои:10.1038 / природа13176. PMID  24670651. S2CID  4467061.
  52. ^ Саузен М., Фаллен Дж., Адлефф В., Джонс С., Лири Р. Дж., Барретт М. Т. и др. (Июль 2015 г.). «Клинические последствия геномных изменений в опухоли и кровообращении у больных раком поджелудочной железы». Nature Communications. 6: 7686. Дои:10.1038 / ncomms8686. ЧВК  4634573. PMID  26154128.
  53. ^ Грассо С.С., Ву Ю.М., Робинсон Д.Р., Цао Х, Дханасекаран С.М., Хан А.П. и др. (Июль 2012 г.). «Мутационный ландшафт смертельного рака простаты, устойчивого к кастрации». Природа. 487 (7406): 239–43. Дои:10.1038 / природа11125. ЧВК  3396711. PMID  22722839.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.